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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001238`

染色体: Chr05 坐标: 10482279-10486634 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001238`
名称	SmilChr05G001238
描述	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10482279 - 10486634 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985936`
GeneID	`130985936`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985936`
原始查询	`SmilChr05G001238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH2
产物	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH2
Arabidopsis	`AT1G55840` (AT1G55840) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842034] identity=65.2; qcov=1; evalue=1.33e-166; confidence=high
Rice	`Os02g0200000` - identity=63.2; qcov=0.997; evalue=9.69e-159; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO); PF03765 (CRAL_TRIO_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985936

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765106.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765106.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765106.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765106.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765106.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10482617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,B99,C87
`Chr5:10482675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B14,B24,B74
`Chr5:10482682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B14,B24,B74
`Chr5:10482798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C57
`Chr5:10482824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:10483537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765106.1

319 aa

160

319

CRAL_TRIO_N

CRAL_TRIO

PF03765 CRAL_TRIO_N 8-59 aa PF00650 CRAL_TRIO 88-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765106.1`	Pfam	`PF03765`	CRAL_TRIO_N	Domain	8	59	1.1e-10	42.2	CRAL/TRIO, N-terminal domain
`XP_057765106.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	88	241	1.5e-17	64.5	CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909123.1
AGAGTATAATTTCTTCCCTCAAATACAACCTTTTTTTTTTGTTTGGGGAGTACAACTTAATACTACTATATTTCTTATATCTTAAAAAAAAAAAGAACTTAACAGATTTCTTATAATTAAAAAATGAAACATTATCCCAAACCCAAAAGTGTACCCAAAAATAGTGCAATTTTGATTTACTGGTTTGCTGCTGGCGCTGACACTTGAGCATTCTATAGCCATTTCTTTTGAAAAAAATCAACAACTAGCATCTTTTTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985936
ATGGCGGTGGTTCCACAAGAAGCCATTAATCAATTTGAGGCGTTAATGGAGGAAGTTGACGAGTCACTGAAAAGAACATTCAAGAATATCCATCAAGGATATCCTCATGAATCTTTGATGCGCTTTCTAAAGGCAAGAGAAGGAAATGTTACCAAGGCCCACAAGATGTTAGTTGATTGTTTGATGTGGAGACTGGAAAACAACATTGATGGAATGTTAGCAAAACCCATTGTTCCAGTGGAGCTGTATAGGGATATACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765106.1
MAVVPQEAINQFEALMEEVDESLKRTFKNIHQGYPHESLMRFLKAREGNVTKAHKMLVDCLMWRLENNIDGMLAKPIVPVELYRDIRESQLIGLSGYSNEGLPVFAVGVGMSTLDRASVHYYIQSHIQMNEYRDRVILPAATKKYGRHVSKCIKVLDMTGLKLSALNYIKLMTTISSIDDLNYPEKTLTYYIVNAPYIFSACWKVVKPLLQERTRRKINVLSGCGQDDLLKIMDYSSLPHFCRKRSSGSSKHLDKNADSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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