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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001239`

染色体: Chr05 坐标: 10504157-10506672 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001239`
名称	SmilChr05G001239
描述	uncharacterized SmilChr05G001239
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10504157 - 10506672 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985937`
GeneID	`130985937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985937`
原始查询	`SmilChr05G001239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0190600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os07g0190600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os07g0190600` - identity=26.4; qcov=0.978; evalue=1.02e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765107.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765107.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765107.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765107.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765107.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10504666`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B65,C39,C65
`Chr5:10504666`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B65,C39,C65
`Chr5:10504667`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	39	A14,A18,A24,A9,B1,B100,B108,B122,B123,B124,B125,B133,B137,B138,B18,B2,B25,B3,B36,B43,B59,B67,B71,B76,B77,B81,B93,B97,C1,C17,C34,C42,C53,C59,C61,C63,C64,C66,D8
`Chr5:10504675`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	34	A14,A9,B1,B100,B108,B123,B124,B125,B133,B137,B138,B18,B2,B25,B3,B59,B67,B71,B76,B77,B81,B93,B97,C1,C17,C34,C42,C53,C59,C61,C63,C64,C66,D8
`Chr5:10504697`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A7,B26,B36,B54,B57,B7,B75,C34,C36,C50,C59,C7,C70,C83,C84,C9,D2
`Chr5:10504840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B17,B41,B67,C46
`Chr5:10504865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:10504872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B82
`Chr5:10504877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B14,B21,B23,B74
`Chr5:10504900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B23
`Chr5:10504920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B10,B29
`Chr5:10505078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B10,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765107.1

182 aa

182

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 118-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765107.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	118	174	7.1e-08	33.1	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909124.1
TTTGTTCACTAAGTCACATTTTCTTCCTTTAATATGGAAGTGGATGATTATTATAATAAGAAAAATAACAAAAATGATCTCTGTTATAGGCGCCTTTGGTGTGTTCAGTCAAAGATCTGCATCCTTCTATTACAACATCAGCAATCAAAGTTAGGGTGGTGCGTGCATATGGAGTACCATTTAATGGGAATTCAAAGGATCTGATGAGCTTTGAATGCATACTGCAAGACCAAGAGGGTGTTAAGATTCATGTTTCTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985937
ATGAAAATTGTGTGTACTTTGTGGGAAGAGTATGTTGATGAATTTCTAAGTCAAGTTGATCCAAATGTGAAACAAATCACAGTGGTACTGATTCAGTTCTGCAGGGCCAATTTATACAAGGGGGAGATAAGAATCTCCACTTCTTACAATGTTTCAAAGGTTCTACTAAACAAAGACACCAAAGAAATGAATGAATTCAGGCAGAGGATTTTTGGAAACATTCGATTCTTTGAAACTATGAACATAACTTTCAACCATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765107.1
MKIVCTLWEEYVDEFLSQVDPNVKQITVVLIQFCRANLYKGEIRISTSYNVSKVLLNKDTKEMNEFRQRIFGNIRFFETMNITFNHEPKRMIDETENLEVKSIEDVFCLEDGCYWICAKVDHIEAIGEWWYMACKCCAKKVEKVDNKFYCDRCNKFDGMANKRFMLRVNVVDASIALMLLYC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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