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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001243`

染色体: Chr05 坐标: 10550936-10553861 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001243`
名称	SmilChr05G001243
描述	oligopeptide transporter 5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10550936 - 10553861 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985939`
GeneID	`130985939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985939`
原始查询	`SmilChr05G001243`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oligopeptide transporter 5-like
产物	oligopeptide transporter 5-like
Arabidopsis	`AT4G26590` (OPT5) oligopeptide transporter 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828766] identity=64.1; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0492000` (OsOPT9) - identity=67; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0035673 (oligopeptide transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF03169 (OPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057765111.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057765111.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057765111.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765111.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10551220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B10,B29
`Chr5:10551221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B10,B29
`Chr5:10551420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:10551615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B14,B24,B74
`Chr5:10551788`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr5:10551788`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr5:10552127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B114
`Chr5:10552127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:10552188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B23
`Chr5:10552382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:10552461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,A24,B110,B134
`Chr5:10552539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765111.1

749 aa

374

749

OPT

PF03169 OPT 50-710 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765111.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	50	710	8.5e-161	537.4	OPT oligopeptide transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909128.1
AACAAAACTGAACTGTTTTAAGGAATCTATTTCTGGTTGGTAGTGCATAGGTGTGACCACACACACCAGTTTCTTCGCATCATCTTGTTGATGTCGTAACTAATAATTATAACCTTTATATAAATCATTAACCCACCCTGCACGGAAAACAAGCCAAACACAAAGATTATAAAAAAAGAGACTGGAAACTAGATTTTGCACCTTTTTGGTTGTTTCTGAATATTGCAGGCACAAATTCTTGTTTCTTGTTTCCTGTTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985939
ATGGAGTCTGCAGAGACCAACACTGTGTCGCAAGATCCCAAGAAACAAGCATCGTATAATACAGTAGAAACAATGGAGGAGGTGAACGATTCTCCGGTTGAGGAAGTCCGGCTGACGGTAGCGATAACGGATGATCCTACGCTGCCGTGTCTGACGTTTCGGACATGGGTGTTGGGGGTAATATCATGTGCAGCTCTAGCCTTCTTGAACCAGTTCTTCGTGTATCGCCAGAACGCCCTCTCTGTATCCTCTGTTTCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765111.1
MESAETNTVSQDPKKQASYNTVETMEEVNDSPVEEVRLTVAITDDPTLPCLTFRTWVLGVISCAALAFLNQFFVYRQNALSVSSVSAQILVLPLGKLMAATLPTKAITIPGTKWSFTMNPGPFNLKEHCLITIFANAGVTGVYAVNIITIVKAFYHRRIDPVAAMLLTHSTQLLGYGWAGIFRKFLVDSPYMWWPANLVQVSLFRALHEVEVRPKGGLTRLQFFTAVSVSSFCYYIIPNYLFPSITALSFVCWIWKDSVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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