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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001250`

染色体: Chr05 坐标: 10632983-10635994 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001250`
名称	SmilChr05G001250
描述	transcription termination factor MTERF4, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10632983 - 10635994 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985945`
GeneID	`130985945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985945`
原始查询	`SmilChr05G001250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription termination factor MTERF4, chloroplastic-like
产物	transcription termination factor MTERF4%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G02990` (BSM) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828116] identity=73.8; qcov=0.884; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0404000` - identity=63.4; qcov=0.874; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765124.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057765126.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057765124.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057765126.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10633732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B63,B79,C54
`Chr5:10633752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:10633776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B23
`Chr5:10633814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:10633847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:10633889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,D6,D8
`Chr5:10634071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C32,C38
`Chr5:10634373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr5:10634490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B112
`Chr5:10634595`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C5
`Chr5:10634595`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C5
`Chr5:10634725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B17,B41,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765124.1

522 aa

261

522

mTERF

PF02536 mTERF 173-481 aa

XP_057765125.1

518 aa

259

518

mTERF

PF02536 mTERF 169-477 aa

XP_057765126.1

475 aa

238

475

mTERF

PF02536 mTERF 126-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765124.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	173	481	3.3e-112	375.2	mTERF
`XP_057765125.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	169	477	3.2e-112	375.2	mTERF
`XP_057765126.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	126	434	2.2e-112	375.8	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909141.1
GGAAGTAAGACGCACCACTTACACAATGACACCGTCGCTTATTTCCATCTTTCCCCCTTAACCCCCCAAAAATCCTTATCATCATCTGCTCTGCTAATTCAAATTTCTTGTTTCTCTATGCCTCTCTCAGTCATTGTCTGAAAAGAAAATCCCAAGACTTCTCCGCCAGTCTTGCTCTTCACCAAGTAAATTAAGTATGTGAAGTTGGATTAGATGCCCAAACCAGTATATGCCTTTGGGGATGAAGATTACAAGCTGTG...

XM_057909142.1
GAAGTAAGACGCACCACTTACACAATGACACCGTCGCTTATTTCCATCTTTCCCCCTTAACCCCCCAAAAATCCTTATCATCATCTGCTCTGCTAATTCAAATTTCTTGTTTCTCTATGCCTCTCTCAGTCATTGTCTGAAAAGAAAATCCCAAGACTTCTCCGCCAGTCTTGCTCTTCACCAAGTAAATTAAGGGGATGAAGATTACAAGCTGTGCCAGCCTCGCCAGACCAAGTCTTCTGCTCGTGCAGTGCGACTTA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130985945
ATGCCTTTGGGGATGAAGATTACAAGCTGTGCCAGCCTCGCCAGACCAAGTCTTCTGCTCGTGCAGTGCGACTTACCTGCTTTCGCGTTCCATGGACCACAATTAATATCAATCTCGACTCCGTGCATTTCAAGTAATTGTATGAAGAGATGTGGATTGGTAATGAAGATTCATTCCTCTGTTGCTGGCCGAACTCGTTCATCCACCTCCAAAGGTGTATCTTTGTCCAGGGGAGATAAATACAATAGGGAGCAGAATGT...

LOC130985945
ATGAAGATTACAAGCTGTGCCAGCCTCGCCAGACCAAGTCTTCTGCTCGTGCAGTGCGACTTACCTGCTTTCGCGTTCCATGGACCACAATTAATATCAATCTCGACTCCGTGCATTTCAAGTAATTGTATGAAGAGATGTGGATTGGTAATGAAGATTCATTCCTCTGTTGCTGGCCGAACTCGTTCATCCACCTCCAAAGGTGTATCTTTGTCCAGGGGAGATAAATACAATAGGGAGCAGAATGTAAATCCTTCATT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765124.1
MPLGMKITSCASLARPSLLLVQCDLPAFAFHGPQLISISTPCISSNCMKRCGLVMKIHSSVAGRTRSSTSKGVSLSRGDKYNREQNVNPSFYTHPSLLELKNERIANRARVYEFLKGIGIVPDELDGLELPVTVEVMRERVDFLHKLGLTVEDINNYPLVLGCSVKKNMVPVLDYLGKLGVRKSTFTEFLRRYPQVLHASVVVDLQPVVNYLQGMDIKPNDIPRVLERYPEVLGFKLEGTMSTSVAYLVGIGVARREIGG...

XP_057765125.1
MKITSCASLARPSLLLVQCDLPAFAFHGPQLISISTPCISSNCMKRCGLVMKIHSSVAGRTRSSTSKGVSLSRGDKYNREQNVNPSFYTHPSLLELKNERIANRARVYEFLKGIGIVPDELDGLELPVTVEVMRERVDFLHKLGLTVEDINNYPLVLGCSVKKNMVPVLDYLGKLGVRKSTFTEFLRRYPQVLHASVVVDLQPVVNYLQGMDIKPNDIPRVLERYPEVLGFKLEGTMSTSVAYLVGIGVARREIGGVLTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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