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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001252`

染色体: Chr05 坐标: 10645985-10650049 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001252`
名称	SmilChr05G001252
描述	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 10-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10645985 - 10650049 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985947`
GeneID	`130985947`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985947`
原始查询	`SmilChr05G001252`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 10-like
产物	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 10-like
Arabidopsis	`AT5G48250` (BBX8) B-box type zinc finger protein with CCT domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834878] identity=43.7; qcov=1.03; evalue=7.47e-94; confidence=medium
Rice	`Os06g0298200` (OsBBX19) - identity=44.6; qcov=1.09; evalue=1.05e-92; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06203 (CCT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985947

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765132.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057765132.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765132.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765132.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10646782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:10646792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35
`Chr5:10646951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B131,B140
`Chr5:10648653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr5:10648773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765132.1

383 aa

192

383

CCT

PF06203 CCT 326-368 aa

XP_057765133.1

383 aa

192

383

CCT

PF06203 CCT 326-368 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765132.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	326	368	1.2e-17	64.4	CCT motif
`XP_057765133.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	326	368	1.2e-17	64.4	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909150.1
AATACTTTAAATAGAATAAAAGTTAATAATTGAGGAAGAAAAACCGAAAGGCGAAGTAGTAGTGTTTTTCGTGGAGGACACTGTGGAAAGATAGAGAGTCGGATACCAAAGCTTCAACAGCGACGTCTACAAATATCGTCCTCACTTTTCGTGATAAACAAAAGAAATAAATTATTGAAAAAGTGCAGAAAAAGGGATATTTCCATTTCAACTCGCGCATCTACTTGTGCGCCTTTGGTTCTCAAACGCTACTCTTATCT...

XM_057909149.1
ACCGAAAGGCGAAGTAGTAGTGTTTTTCGTGGAGGACACTGTGGAAAGATAGAGAGTCGGATACCAAAGCTTCAACAGCGACGTCTACAAATATCGTCCTCACTTTTCGTGATAAACAAAAGAAATAAATTATTGAAAAAGTGCAGAAAAAGGGATATTTCCATTTCAACTCGCGCATCTACTTGTGCGCCTTTGGTTCTCAAACGCTACTCTTATCTTCTTATCAGTTCATCATCCCTCCTCCTTCCTCCGCCGCGAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985947
ATGGGTCGGTTATGCGATTTCTGCGGGGAGCAAAGATCCATAATCCATTGTAGGTCTGATGCTGCTTGCTTATGCTTATCCTGTGATCGGAATGTTCATTCTGCAAATGCTCTTTCGAAGCGCCATTTGAGGACCCTTTTATGTGAAAGATGCCATTCTCAGCCTGCGATAACGAGGTGCATCCAAGAGAACACCTCACTTTGTCAAGACTGCAATTGGTCTGGACATTCTGCTGCACCAGCTTCAGATGTCGAGCATAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765132.1
MGRLCDFCGEQRSIIHCRSDAACLCLSCDRNVHSANALSKRHLRTLLCERCHSQPAITRCIQENTSLCQDCNWSGHSAAPASDVEHKRQMINLYSGCPSAADFSRIWSFFSVDKSISNPEPDPMSLEEGEESPSRCELSHADCCTEDTGMEIIAPEAEQIHGGGHVDSLNQKACSPKKDPGPTHETPSQNFYISDTELSLDDYEALFDESRDETQQFFDNGGADSFFGMEDYNTECNVKGVTTKASSSKVETLKQDCSNQ...

XP_057765133.1
MGRLCDFCGEQRSIIHCRSDAACLCLSCDRNVHSANALSKRHLRTLLCERCHSQPAITRCIQENTSLCQDCNWSGHSAAPASDVEHKRQMINLYSGCPSAADFSRIWSFFSVDKSISNPEPDPMSLEEGEESPSRCELSHADCCTEDTGMEIIAPEAEQIHGGGHVDSLNQKACSPKKDPGPTHETPSQNFYISDTELSLDDYEALFDESRDETQQFFDNGGADSFFGMEDYNTECNVKGVTTKASSSKVETLKQDCSNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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