当前解析结果
SmilChr05G001254| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001254 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001254 |
| 描述 | calcineurin B-like protein 2 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 10666886 - 10669189 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025508 |
|---|---|
| GeneID | 131025508 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025508 |
| 原始查询 | SmilChr05G001254 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | calcineurin B-like protein 2 |
| 产物 | calcineurin B-like protein 2 |
| Arabidopsis | AT5G55990 (CBL2)calcineurin B-like protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835697] identity=87.1; qcov=0.727; evalue=2.57e-48; confidence=medium |
| Rice | Os03g0626800 (OsCBL3)- identity=82.8; qcov=0.727; evalue=4.86e-47; confidence=medium |
| GO | GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0019722 (calcium-mediated signaling); GO:0019900 (kinase binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025508 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811285.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057811285.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811285.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811285.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811285.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:10666907 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 8 | B85,C12,C14,C32,C39,C47,C65,C68 |
Chr5:10667819 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B119,B138,B17,B24 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。