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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001257`

染色体: Chr05 坐标: 10703207-10707900 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001257`
名称	SmilChr05G001257
描述	DNA-directed RNA polymerases IV and V subunit 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10703207 - 10707900 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985951`
GeneID	`130985951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985951`
原始查询	`SmilChr05G001257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerases IV and V subunit 4-like
产物	DNA-directed RNA polymerases IV and V subunit 4-like
Arabidopsis	`AT5G09920` (NRPB4) RNA polymerase II, Rpb4, core protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830853] identity=38.7; qcov=0.423; evalue=4.31e-21; confidence=low
Rice	`Os02g0723300` - identity=36.1; qcov=1.09; evalue=1.72e-41; confidence=medium
GO	GO:0000166 (nucleotide binding); GO:0006352 (DNA-templated transcription initiation); GO:0030880 (RNA polymerase complex)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03874 (RNA_pol_Rpb4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765168.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057765168.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057765168.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057765168.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765168.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10705815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:10707390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B10,B29,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765168.1

220 aa

110

220

RNA_pol_Rpb4

PF03874 RNA_pol_Rpb4 99-194 aa

XP_057765169.1

220 aa

110

220

RNA_pol_Rpb4

PF03874 RNA_pol_Rpb4 99-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765168.1`	Pfam	`PF03874`	RNA_pol_Rpb4	Family	99	194	3.4e-10	40.9	RNA polymerase Rpb4
`XP_057765169.1`	Pfam	`PF03874`	RNA_pol_Rpb4	Family	99	194	3.4e-10	40.9	RNA polymerase Rpb4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909185.1
GTGGAAAGTGGAAACTGTAAAATTTGTTACACACAACACAATTTAGGGAAATTGGAGTTTGGCCCCTGCAATTTCGCCAAATTGACATTTCCAGCATTAATTTAATTAAAATATTCCCAGGAATGATGTTAGAATTGCAGAGTGTGCTGCTCTAGAACCCCAACTCGAGTCTTCTCCGGTGGACTATCACAGCCTTCAACTTCAGCTCCGGCCGCCCTTCCTTACGGGCTTGGGCAATTCAAGAATAACAGAATGTCGGA...

XM_057909186.1
AATTGCAGAGTGTGCTGCTCTAGAACCCCAACTCGAGTCTTCTCCGGTGGACTATCACAGCCTTCAACTTCAGCTCCGGCCGCCCTTCCTTACGAAAATTGGAATGCCTGCGTATTTGTAGGGCTTGGGCAATTCAAGAATAACAGAATGTCGGAGAAAGGAGGAAAAGGAAATTTATCGGGAAAAGGGGGCAAGTCTGCTCTAAAATCACCCGTTCAGAATGGTGACAGCTCAGGGAAACAGAGAAAGGGAAAAAAAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985951
ATGTCGGAGAAAGGAGGAAAAGGAAATTTATCGGGAAAAGGGGGCAAGTCTGCTCTAAAATCACCCGTTCAGAATGGTGACAGCTCAGGGAAACAGAGAAAGGGAAAAAAAGTTCAGTTTGATTCTGAAGATCCTATTGAAACCAATACTCCAAAATCTAATGGGAAGGCCGATACTCCAGCTGCAACAGGTGGAAAAGGAGACAAAACTGCAAATGGCTCTAAAAAGTCCACAGGGAAAGGACCAACCCCAGTGGAGCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765168.1
MSEKGGKGNLSGKGGKSALKSPVQNGDSSGKQRKGKKVQFDSEDPIETNTPKSNGKADTPAATGGKGDKTANGSKKSTGKGPTPVERRLAQELPPNSACLMDCEAAEILQSIQDQMVILSQDPDIKLPVSFDTGLTYAKRGGNYAKPETVKKIFEPLKKHGVSDCEICLIANICPESVDEVFAVVPALKPKMSKLRDPLRIALDELANLKEALANLKNSA

XP_057765169.1
MSEKGGKGNLSGKGGKSALKSPVQNGDSSGKQRKGKKVQFDSEDPIETNTPKSNGKADTPAATGGKGDKTANGSKKSTGKGPTPVERRLAQELPPNSACLMDCEAAEILQSIQDQMVILSQDPDIKLPVSFDTGLTYAKRGGNYAKPETVKKIFEPLKKHGVSDCEICLIANICPESVDEVFAVVPALKPKMSKLRDPLRIALDELANLKEALANLKNSA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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