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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001262`

染色体: Chr05 坐标: 10758983-10762043 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001262`
名称	SmilChr05G001262
描述	ras-related protein RABB1c
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10758983 - 10762043 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985958`
GeneID	`130985958`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985958`
原始查询	`SmilChr05G001262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein RABB1c
产物	ras-related protein RABB1c
Arabidopsis	`AT4G17170` (RABB1C) RAB GTPase homolog B1C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827428] identity=99; qcov=0.995; evalue=7.77e-158; confidence=high
Rice	`Os02g0586400` (OsRab2A2) - identity=96.3; qcov=0.9; evalue=1.75e-138; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005794 (Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985958

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057765176.1`
2	Phagosome	Phagosome	1.00000	`XP_057765176.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057765176.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057765176.1`
5	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057765176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10759884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765176.1

211 aa

106

211

Arf

Roc

Ras

MMR_HSR1

PF00025 Arf 7-160 aa PF08477 Roc 8-122 aa PF00071 Ras 8-168 aa PF01926 MMR_HSR1 10-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765176.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	7	160	3.1e-12	47.0	ADP-ribosylation factor family
`XP_057765176.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	8	122	2.9e-33	115.3	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057765176.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	8	168	2.2e-64	216.6	Ras family
`XP_057765176.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	10	112	4.6e-05	24.2	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909193.1
AGGATGGAGTATAATTTTGATTACAATGGGGAGTAAAGCGTATGTGCTTCGCTGGAATCGTCTGGATTAAGCGTTAATTCCTTCTCACTCACTTTATAAAAAATACTCACAATTAATTAATTTAGATCATGCTGCCAACCGTACCACTGGTCTTCGTTTATCTTTGCGCCTTCCGAACTTCATTTCGTCTTCTTTCTCCATTTTCAAATTCCCCATTTCCGAGATCCATATTCGATTGATCTGCCCTAGATATGTCTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985958
ATGTCTTACGCATATCTCTTCAAGTATATCATCATCGGCGATACAGGGGTTGGAAAGTCATGTCTTCTTCTACAATTTACCGACAAACGTTTCCAGCCAGTGCATGACTTGACTATTGGAGTCGAATTTGGGGCTCGGATGATTACAATAGACAACAAACCCATTAAGCTTCAAATATGGGACACGGCCGGTCAAGAATCCTTCAGATCCATCACAAGGTCATACTACAGAGGAGCTGCTGGTGCACTTTTGGTTTATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765176.1
MSYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDNKPIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHLASWLEDARQHANPNMTIMLIGNKCDLAHRRAVSTEEGEQFAKEHGLIFMEASAKTAQNVEEAFIKTAATIYKKIQDGVFDVSNESYGIKVGYGGIPGPSGGRDGSSSQGGGCCS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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