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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001276`

染色体: Chr05 坐标: 10910348-10913255 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001276`
名称	SmilChr05G001276
描述	protein ENDOSPERM DEFECTIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10910348 - 10913255 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985975`
GeneID	`130985975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985975`
原始查询	`SmilChr05G001276`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ENDOSPERM DEFECTIVE 1-like
产物	protein ENDOSPERM DEFECTIVE 1-like
Arabidopsis	`AT2G44190` (EDE1) ENDOSPERM DEFECTIVE protein (DUF566) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819026] identity=45.2; qcov=0.467; evalue=8.65e-57; confidence=medium
Rice	`Os09g0422600` - identity=37.6; qcov=0.432; evalue=5.07e-38; confidence=low
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005813 (centrosome); GO:0005880 (nuclear microtubule); GO:0007098 (centrosome cycle); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0051225 (spindle assembly)
KEGG	-
Pfam	PF04484 (QWRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057765208.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057765208.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057765208.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765208.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10911131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B49
`Chr5:10912118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D4
`Chr5:10912151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B41,C46
`Chr5:10912154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C3
`Chr5:10912415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C46
`Chr5:10912493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:10912544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B41,C46
`Chr5:10912674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B9
`Chr5:10912872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:10912906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765208.1

493 aa

246

493

QWRF

PF04484 QWRF 146-448 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765208.1`	Pfam	`PF04484`	QWRF	Family	146	448	2e-59	202.5	QWRF family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909225.1
AGGCCGTCCAGTCGGGTCGGGTCTACACAACATTTTCAAAAAGATGAGAATCTGGGATCATGAATATTATATTATTGGCAAATAAGAAATAGAACCGTTACCCCGTGGCCGTGGTTATAGTTTATATTTTGCAACGGCTAGTTTTTTAATCATCTCTTTTCTCTTTACCATTTACAAAATCTTCTCTTTCTCGCCTGCAACATTCTTACAGTGGGATTATTCGTTTTCTCTCTTCAATCATTGCCGAATCCTTGCAATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985975
ATGGGCGACCAAACCGGTGGAGCTGCAGCCGACACGGCGTCGGCGCCACCAGCTCCGCCGCTTCCACACCGCCGTCCAAGAGTGAGAGAAGTCAGTTCTCGGTTCATGTCGCCTTTAGTCCAATCCAATTCAACCCCAGCCCCGACTCCTCACCCTTCCGATTTTCCACGCACCAAATCCGTACACCGCCGCCATCCCTCTAAAACCGACGAGAATTTTAACCCGGAGCCAAACCGCGGCAGCCTAGACAAACTGTCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765208.1
MGDQTGGAAADTASAPPAPPLPHRRPRVREVSSRFMSPLVQSNSTPAPTPHPSDFPRTKSVHRRHPSKTDENFNPEPNRGSLDKLSAAISTIQRKQHQQQQRVNSKDHHQSEVRVSSRPDTPIATGTDRIVPSRFRQSVHRSNSLSSSNNGCSAVTAAARLLQEATSDVENKLSRISTSSVDDSDSCSATTSNQGSSSCPNSPLCVPVTKLRSATDVRSSMPDVDKWLTDRNFENSGKDCARSLNFSSFSKIGGGGVSRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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