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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001279`

染色体: Chr05 坐标: 10947452-10955587 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001279`
名称	SmilChr05G001279
描述	ABC transporter D family member 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	10947452 - 10955587 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985977`
GeneID	`130985977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985977`
原始查询	`SmilChr05G001279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter D family member 2, chloroplastic
产物	ABC transporter D family member 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G54350` (ABCD2) ABC transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841876] identity=64.5; qcov=0.934; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0218700` (OsABCD1) - identity=65.8; qcov=0.9; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF05992 (SbmA_BacA); PF06472 (ABC_membrane_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765211.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057765211.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057765212.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765211.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765211.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:10947763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:10947957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr5:10948189`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr5:10948189`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr5:10948214`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C73
`Chr5:10948214`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C73
`Chr5:10948216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr5:10948884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C79
`Chr5:10948908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B8,C28,D6
`Chr5:10949143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,D6
`Chr5:10950102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:10950153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765211.1

747 aa

374

747

ABC_membrane_2

SbmA_BacA

ABC_tran

PF06472 ABC_membrane_2 110-370 aa PF05992 SbmA_BacA 153-418 aa PF00005 ABC_tran 478-679 aa

XP_057765212.1

743 aa

372

743

ABC_membrane_2

SbmA_BacA

ABC_tran

PF06472 ABC_membrane_2 106-366 aa PF05992 SbmA_BacA 149-414 aa PF00005 ABC_tran 474-675 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765211.1`	Pfam	`PF06472`	ABC_membrane_2	Family	110	370	4.4e-50	171.3	ABC transporter transmembrane region 2
`XP_057765211.1`	Pfam	`PF05992`	SbmA_BacA	Family	153	418	8e-18	65.6	SbmA/BacA-like family
`XP_057765211.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	478	679	8.8e-19	69.2	ABC transporter
`XP_057765212.1`	Pfam	`PF06472`	ABC_membrane_2	Family	106	366	4.4e-50	171.3	ABC transporter transmembrane region 2
`XP_057765212.1`	Pfam	`PF05992`	SbmA_BacA	Family	149	414	7.8e-18	65.6	SbmA/BacA-like family
`XP_057765212.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	474	675	8.7e-19	69.2	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909228.1
TGATTTAATTTGGGCCTGCTTTGCCCAAAAGCAGGTCCACGCGATTTTTTAAAATTATTTGTTTGAAAAAAAGAAAAACCAGTCAAAGTGTTCTTCAAAAAAAAAGTGTTATCCCTCAAAAAAAAAAGTGTTGTCTTATTAGCCGACGTGGCGTATTGAGAGCTGCGAATTTTCAGATAATTTTGTTTCCGCCAATTTTTTCTCAACGGAGGTTGAATAATAGCAGAAATTTATACACCACGAATACCAAAACTGAGATG...

XM_057909229.1
TTTCCGCCAATTTTTTCTCAACGGAGGTTGAATAATAGCAGAAATTTATACACCACGAATACCAAAACTGAGATGCAGCGGAAATAGTCTCAACGTCGGGAAAAATGATCGGACTTGAGTTCCCGACCTACCTGCCGGTGCAAAATTTCCACGGTAAAAGCAGCTTCCTTCCTAGCGGCTGCTATGGATACCAATTGAAGCACAAGAAGAAGTTGTACCATTTCACATTAAAGCCTAACACTTCAATGCTCGTCGCTTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985977
ATGATCGGACTTGAGTTCCCGACCTACCTGCCGGTGCAAAATTTCCACGGTAAAAGCAGCTTCCTTCCTAGCGGCTGCTATGGATACCAATTGAAGCACAAGAAGAAGTTGTACCATTTCACATTAAAGCCTAACACTTCAATGCTCGTCGCTTTGAGAAGGAGAAAGCGCAACCGCACGTCATTTTCAGTTTCCGTCGCGAGGTCATCTTTGGTTCCGCCGGAGCAACCGCCCGGGCCCCAATCTAATCAGGAGGATCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765211.1
MIGLEFPTYLPVQNFHGKSSFLPSGCYGYQLKHKKKLYHFTLKPNTSMLVALRRRKRNRTSFSVSVARSSLVPPEQPPGPQSNQEDPQRNPPDVQTLAKRFWKVAAPYWFSDDKATARWRLATVFALTLGTTGISVGFNFLGRDFFNALANKDQEQFTKQLVYYLAAFAGGIPVFVLRDYAKDTLSLRWRSWMTSFYMDRYLKNQTFYKIQSQSIIDNPDQRIVDDLSAFTGTALAFSLTLFNASVDLISFSNILYGIYP...

XP_057765212.1
MIGLEFPTYLPVQNFHGKSSFLPSGCYGYQLKHKKKLYHFTLKPNTSMLVALRRRKRNRTSFSVSVARSSLVPPEQPPGPQSNQRNPPDVQTLAKRFWKVAAPYWFSDDKATARWRLATVFALTLGTTGISVGFNFLGRDFFNALANKDQEQFTKQLVYYLAAFAGGIPVFVLRDYAKDTLSLRWRSWMTSFYMDRYLKNQTFYKIQSQSIIDNPDQRIVDDLSAFTGTALAFSLTLFNASVDLISFSNILYGIYPPLFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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