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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001289`

染色体: Chr05 坐标: 11016653-11035300 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001289`
名称	SmilChr05G001289
描述	protein FORGETTER 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11016653 - 11035300 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985982`
GeneID	`130985982`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985982`
原始查询	`SmilChr05G001289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FORGETTER 1
产物	protein FORGETTER 1
Arabidopsis	`AT1G79350` (EMB1135) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844273] identity=73.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0609700` - identity=68.3; qcov=0.662; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0031490 (chromatin DNA binding); GO:0042393 (histone binding)
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD); PF04851 (ResIII); PF13871 (Helicase_C_4); PF13872 (AAA_34); PF23547 (Zn_ribbon_FGT1_1); PF23548 (Zn_ribbon_FGT1_2); PF25373 (SBNO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985982

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057765219.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057765219.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057765219.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765219.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11017551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C32
`Chr5:11017566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C32
`Chr5:11017575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C32
`Chr5:11017578`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A4,B78,B87,C32
`Chr5:11017578`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A4,B78,B87,C32
`Chr5:11017585`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B78,B87,C32
`Chr5:11017585`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B78,B87,C32
`Chr5:11017601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C32
`Chr5:11018991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C28
`Chr5:11024692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:11024878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:11030182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765219.1

1249 aa

624

1249

Zn_ribbon_FGT1_1

Zn_ribbon_FGT1_2

AAA_34

ResIII

PHD

Helicase_C_4

SBNO

PF23547 Zn_ribbon_FGT1_1 33-67 aa PF23547 Zn_ribbon_FGT1_1 94-124 aa PF23548 Zn_ribbon_FGT1_2 94-126 aa PF13872 AAA_34 184-484 aa PF04851 ResIII 251-368 aa PF00628 PHD 662-706 aa PF13871 Helicase_C_4 750-1027 aa PF25373 SBNO 1063-1176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765219.1`	Pfam	`PF23547`	Zn_ribbon_FGT1_1	Domain	33	67	5.7e-30	103.3	FORGETTER1 first zinc ribbon domain
`XP_057765219.1`	Pfam	`PF23547`	Zn_ribbon_FGT1_1	Domain	94	124	5.7e-30	103.3	FORGETTER1 first zinc ribbon domain
`XP_057765219.1`	Pfam	`PF23548`	Zn_ribbon_FGT1_2	Domain	94	126	9.4e-18	64.2	FORGETTER1 second zinc ribbon domain
`XP_057765219.1`	Pfam	`PF13872`	AAA_34	Domain	184	484	2.6e-133	444.4	P-loop containing NTP hydrolase pore-1
`XP_057765219.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	251	368	2e-05	25.3	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057765219.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	662	706	4.3e-06	27.4	PHD-finger
`XP_057765219.1`	Pfam	`PF13871`	Helicase_C_4	Domain	750	1027	4.6e-103	345.4	C-terminal domain on Strawberry notch homologue
`XP_057765219.1`	Pfam	`PF25373`	SBNO	Domain	1063	1176	4.8e-19	69.4	SBNO alpha/beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089129.1
GAGTCACGCACACCCACCCACCCACCCTCACCGAGAGAGCGCCAAACCCAAACGGAAATCCCCCTCTACTTTTTTATTCCTTTTGCCGCTCTCTCTCTCTCCCCTGAAAATTCACCTCACCTCACCCCAACCAAACCCTCATATTAACGTACCTTCAGTTTTTCAAAATCGAATCCAATTTCCTCCTAATTCTCACCACTTCACTCATCACTCAATCCTTTCCCATCTCCACCAATCCACAATTTCTCCCTAGCTGCATC...

XM_057909236.1
GAGTCACGCACACCCACCCACCCACCCTCACCGAGAGAGCGCCAAACCCAAACGGAAATCCCCCTCTACTTTTTTATTCCTTTTGCCGCTCTCTCTCTCTCCCCTGAAAATTCACCTCACCTCACCCCAACCAAACCCTCATATTAACGTACCTTCAGTTTTTCAAAATCGAATCCAATTTCCTCCTAATTCTCACCACTTCACTCATCACTCAATCCTTTCCCATCTCCACCAATCCACAATTTCTCCCTAGCTGCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985982
ATGGGGCAGCCCTCGTTGCCGCCTCCGCCAATTGCCCCTCCACCGCCACCGCCGCTCCCGCCGCCGGCTCAGCTCGGTGCCGGCCCCGCCGCTGGGTGCCAGGTGCGCTGCGCCGGTTGCAAGATGGTGCTTACCGTGATGCCTGGCCTGACCGAGTTCGTCTGCCCTACGTGCCAGCTACCGCAGATGCTGCCGCCCGAGTTGATGCGGTCCAACCAGGCCCAGGCCCAGGCCCAGCAGCAACGGACTGCCCCGGCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765219.1
MGQPSLPPPPIAPPPPPPLPPPAQLGAGPAAGCQVRCAGCKMVLTVMPGLTEFVCPTCQLPQMLPPELMRSNQAQAQAQQQRTAPAHGIDPTKIQLPCANCKAILNVPHGLSRFNCPQCQISLAVDLSKISQVLPPPVRPPLPLPPAEEVNEVAIEVEREEDEGGLAGETFTDYRPPKLSIGPPHPDPVVETSSLSAVQPPEPTYDLRIKDKLESSKALSCLQIETLVYACQRHLQHLPGGDRAGFFLGDGAGVGKGRTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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