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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001293`

染色体: Chr05 坐标: 11083142-11085198 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001293`
名称	SmilChr05G001293
描述	organic cation/carnitine transporter 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11083142 - 11085198 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985992`
GeneID	`130985992`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985992`
原始查询	`SmilChr05G001293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organic cation/carnitine transporter 3-like
产物	organic cation/carnitine transporter 3-like
Arabidopsis	`AT1G16390` (OCT3) organic cation/carnitine transporter 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838209] identity=59; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0562400` - identity=47.4; qcov=1.02; evalue=2.51e-160; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00083 (Sugar_tr); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985992

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057765229.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057765229.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057765229.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765229.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765229.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11083321`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr5:11083321`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr5:11083403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B12,B13
`Chr5:11083477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr5:11083558`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	201	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A6,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B56,B57,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B8,B80,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C83,C84,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr5:11083568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:11083592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	202	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A6,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B56,B57,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B8,B80,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr5:11083652`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A13,A14,A18,A25,A6,A7,B10,B103,B106,B107,B11,B113,B134,B135,B138,B19,B29,B34,B41,B45,B5,B52,B64,B7,B72,B73,B80,B83,B86,B87,B90,B92,B94,B97,C10,C12,C15,C20,C24,C26,C28,C3,C31,C38,C40,C50,C51,C56,C59,C61,C78,C84,D1,D2,D9
`Chr5:11083662`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B102,B124,B131,B14,B15,B18,B31,B36,B38,C22,C33,C70,C71,D4
`Chr5:11083719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B31
`Chr5:11083891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C75
`Chr5:11083891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765229.1

517 aa

258

517

Sugar_tr

MFS_1

PF00083 Sugar_tr 114-495 aa PF07690 MFS_1 116-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765229.1`	Pfam	`PF00083`	Sugar_tr	Family	114	495	2.7e-26	93.2	Sugar (and other) transporter
`XP_057765229.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	116	456	2.4e-22	80.1	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909246.1
GTGACATAAATGAGCTGATCAAGACCATCTCTCTTCCTGTAACTAAACAAAAAAGATGTGTCTATCTTCCTTCCTCGTGTTCTACTCGTGTCACATTTTTTCATTCGGATGAATCTTAAATCATATTTTCATAAATTCTGCAAATCTTCTTTAATATAATTAATTATGAAAATTTTAGAATGTAAAAAAAAATAAAGCATCTATATATATAGGAAATTCTGAATCATACTGTATTTTGTTTATTTCAGCAGCAAACACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985992
ATGACGGATCCGCACCCACTTCTCTCCCACACGGCGCCGCCGGAAAAGGGAGCGCCGCCGCAGTACCAGCGCAGCTCCTCCCTCGACGACACCATCGAGCACTGCATCGGCGACTTAGGCTGGAAACACATACTCCAAGCCACCCTCGTCTCCTTCGCCTGGTTCTTCGATGCGCAGCAGACATTCATCAGCGTCTTCACCGACGCCGAGCCCCAATGGAGCTGCGTCGAATCATGCGCCGGCGCCGACCTCTGCCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765229.1
MTDPHPLLSHTAPPEKGAPPQYQRSSSLDDTIEHCIGDLGWKHILQATLVSFAWFFDAQQTFISVFTDAEPQWSCVESCAGADLCQLPAAAWAWVTPADASIISDWSLQCAGSIVKGLPASSFFFGCLVGGFALATLADSSLGRKKMLVLSSLLMSLTGVLTALSTGIWMYTALRFVSGFGRATIGTCALVLSTELVGKKWRENIGIIGFICFTLGFLSLPVIAYWSRDSSWRLMYLWTCVPSVIYSISLMFIVPESPRW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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