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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001299`

染色体: Chr05 坐标: 11213171-11220589 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001299`
名称	SmilChr05G001299
描述	uncharacterized SmilChr05G001299
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11213171 - 11220589 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985999`
GeneID	`130985999`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985999`
原始查询	`SmilChr05G001299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transglycosylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838198]; symbol=AT1G16290; hit=AT1G16290; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transglycosylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838198]; symbol=AT1G16290; hit=AT1G16290; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G16290` (AT1G16290) transglycosylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838198] identity=59.2; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0170900` - identity=67.2; qcov=0.14; evalue=1.61e-24; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01464 (SLT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985999

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765234.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057765234.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765234.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765234.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11214613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B61,B79,B8
`Chr5:11214655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:11214740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:11214788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:11216096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:11216101`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr5:11216101`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr5:11219469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr5:11219510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B29,B76,B82
`Chr5:11219512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B76,B79,C57,C62
`Chr5:11219525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B56,B96
`Chr5:11219526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B126,B71,C5,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765234.1

435 aa

218

435

SLT

PF01464 SLT 85-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765234.1`	Pfam	`PF01464`	SLT	Domain	85	199	3e-18	66.2	Transglycosylase SLT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909251.1
TGGGATGGCGGCAAATATTTGTTTGGCAAGAGCGCAAAGCGGTGGGACAAGCCACGTATCACATCGGACAGCCTCTATTCAACGGCGTAAAAGGAAACTTCAACAGCTCGTCAGATCAAACCCAACCAACTCAATTCCCATAATTTTTGTGAATTTGTTCTTATCAACTTTGATCCATTGCATTGCCTCAAATTATCCGATTTCTTCGCTCAAACTTTTCTATTTATCTTTTCAAAAATACAAGTGAAATCGAGGTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985999
ATGTGCCGAACATCATTTGGCATGCATTTTAAGATGGAAGCTGTCAGCTTTAGATACTGGAATGACTGTGTGGATCCTGAGGACTTGGAGGCAATGTGGGCAGAGCCTGATGTAAGATCAGAGTGGATTAACGCTGGAGAGACTAAGGGATCCAAGGTCCACCTCTCACGTGATCCTGACGGTCAGCCTTTTTTAACACAGACTGAAATGAGGGCTGTAGCAGGAATTATTGTCCAAAGGCATTTTGTCTCTCAAATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765234.1
MCRTSFGMHFKMEAVSFRYWNDCVDPEDLEAMWAEPDVRSEWINAGETKGSKVHLSRDPDGQPFLTQTEMRAVAGIIVQRHFVSQIDLDMLCAIAEIESDRLPLAKSYNKKSDEVKMGIMQISPKIAEWFIRELGYRTYNMAEDSTPMYKPFLNVYIAAAYLKWLSKFDNKERSEEFMIRAYKGGTKKATHKSTLPYWKKYLSVKESLPSRKVFGVGFALDVPSHSAAGVSQSKGPIHATWDSKTSPEDMELMWKNRDVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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