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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001301`

染色体: Chr05 坐标: 11243371-11245954 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001301`
名称	SmilChr05G001301
描述	nuclear transcription factor Y subunit C-2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11243371 - 11245954 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986002`
GeneID	`130986002`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986002`
原始查询	`SmilChr05G001301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transcription factor Y subunit C-2
产物	nuclear transcription factor Y subunit C-2
Arabidopsis	`AT1G56170` (NF-YC2) nuclear factor Y, subunit C2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842070] identity=87.7; qcov=0.496; evalue=2.85e-80; confidence=medium
Rice	`Os02g0170500` (OsHAP5A) - identity=72.7; qcov=0.672; evalue=2.01e-79; confidence=high
GO	GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone); PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986002

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765239.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765239.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765239.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765239.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11245064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:11245165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:11245360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:11245432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B76,C53
`Chr5:11245480`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B13,B22,B40,B49,B71,B91,B94,C15,C44,C61,D2,D8
`Chr5:11245528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:11245649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:11245652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C53
`Chr5:11245710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765239.1

262 aa

131

262

Histone

CBFD_NFYB_HMF

PF00125 Histone 93-164 aa PF00808 CBFD_NFYB_HMF 101-164 aa

XP_057765240.1

262 aa

131

262

Histone

CBFD_NFYB_HMF

PF00125 Histone 93-164 aa PF00808 CBFD_NFYB_HMF 101-164 aa

XP_057765241.1

262 aa

131

262

Histone

CBFD_NFYB_HMF

PF00125 Histone 93-164 aa PF00808 CBFD_NFYB_HMF 101-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765239.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	93	164	5.7e-18	65.8	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain
`XP_057765239.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	101	164	1e-16	61.7	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone
`XP_057765240.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	93	164	5.7e-18	65.8	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain
`XP_057765240.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	101	164	1e-16	61.7	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone
`XP_057765241.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	93	164	5.7e-18	65.8	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain
`XP_057765241.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	101	164	1e-16	61.7	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909256.1
TGAGTAAAGAAACGTGGATGTGGGAATTTAATGTTAAAGTAGAGGGTGGGGTGAGGTGAGGTGAGCTCGCCTACGTCACAGGGAGCACCAACGGTTAATCGACACGTGGAGTATCCGGCTCTCGAGCAGACGCCACGCGTCTCATTTCCCCACAAGATTCTCTCTCTCTCATCGGACCATATTCAAAACCCTCTCTCCGCTGTCCCTCCTTTTTCTCCTTCTTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACAGTT...

XM_057909257.1
TTTTGCACTTATTCATCTCTGTTTCTTTGTTTGATTTTTCTATGGTGCTAAAATGTTTCTATGGGGATGCCTTTATTTCTTCTCAATTTTTTATTTTGGGTGTTTTGATGTTTTGTGCTTTTATTTTATGTGCTGCTTAACTCTTGATTGTTGGTTTTAAATATTCGAGTTGACCTCATGATCACCCAGCTAAACTTAGTTCGTTCCTAAAATTAAAAGAATAGTTTAAATAAGTGTCGGAGTAAGTAAAAAGTTACCAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986002
ATGGACCATTCAGATCAAAGGCAGCAGCAACTGGCACACCAGAATCAGCAACAGCAGCAGGGAGTTGCAGCAGGCGGTGGGTCGATGGCTTATGCCACTCCCCCCTATCAAACAGCACCAATGGTGGCTACTGGCACTCCTGCTGGCACAGTTTCCTCTCCAACTAGTTTCACTCCTCAGCAACAACTCGCCTACCACCAGGCCCAGCAATTTCACAGTCAACAGCAGCAGCAACAACTTCAAGCATTTTGGGCGAATCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765239.1
MDHSDQRQQQLAHQNQQQQQGVAAGGGSMAYATPPYQTAPMVATGTPAGTVSSPTSFTPQQQLAYHQAQQFHSQQQQQQLQAFWANQMQEIDQTTDFKNHSLPLARIKKIMKADEDVRMISAEAPVIFAKACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQKNDIAAAISRTDVFDFLVDIIPRDELKEEGLGITKAAIPLVGSTPDALPYYYVPPQAPVGAPGMIMGKPIDQAALYGGQPPPPFMPWPQSHPSQQPPPSQQEQQ...

XP_057765240.1
MDHSDQRQQQLAHQNQQQQQGVAAGGGSMAYATPPYQTAPMVATGTPAGTVSSPTSFTPQQQLAYHQAQQFHSQQQQQQLQAFWANQMQEIDQTTDFKNHSLPLARIKKIMKADEDVRMISAEAPVIFAKACEMFILELTLRSWIHTEENKRRTLQKNDIAAAISRTDVFDFLVDIIPRDELKEEGLGITKAAIPLVGSTPDALPYYYVPPQAPVGAPGMIMGKPIDQAALYGGQPPPPFMPWPQSHPSQQPPPSQQEQQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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