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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001304`

染色体: Chr05 坐标: 11256126-11257890 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001304`
名称	SmilChr05G001304
描述	peroxisomal 2,4-dienoyl-CoA reductase [(3E)-enoyl-CoA-producing]
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11256126 - 11257890 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986006`
GeneID	`130986006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986006`
原始查询	`SmilChr05G001304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisomal 2,4-dienoyl-CoA reductase [(3E)-enoyl-CoA-producing]
产物	peroxisomal 2%2C4-dienoyl-CoA reductase [(3E)-enoyl-CoA-producing]
Arabidopsis	`AT3G12800` (SDRB) short-chain dehydrogenase-reductase B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820462] identity=78; qcov=1; evalue=1.61e-160; confidence=high
Rice	`Os04g0614000` - identity=69.3; qcov=1; evalue=5.2e-155; confidence=high
GO	GO:0008670 (2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH) activity); GO:0009062 (fatty acid catabolic process)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057765244.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765244.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765244.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765244.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765244.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11256803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr5:11257041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,D11
`Chr5:11257230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765244.1

300 aa

150

300

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 13-213 aa PF08659 KR 15-165 aa PF13561 adh_short_C2 22-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765244.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	13	213	1.5e-38	133.0	short chain dehydrogenase
`XP_057765244.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	15	165	5e-07	30.5	KR domain
`XP_057765244.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	22	264	8.5e-47	160.4	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909261.1
ATTAGGGCTGACAATTTTTGACATGATACGAAAATATGATACACTCTTACAGGATGGAGGGAGTATAATGTTTCCCAAGTAATTGGAGGAGCAAGAATTTAGGTGAATATGCCGACCAAAATCTGAATTAAAAAAAAATGAGAGGCGGATTTAATTAGTGAGGAGGAGATTGAATTATATAGGCCGGCAGTGATCAGCTTTAAGCTAGTTGTGGATTTGGTGATTGACCTAACCTATTTCTTCCTCTAGTATTCCACTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986006
ATGGAATCTCCATTCAAGTCCGACGTTCTCAAAGGAAAGGTAGCTCTGCTCACCGGGGGCGGCTCCGGTATCGGGTTTGAGATCTCCACCCAGTTTGGGAAGCACGGAGCCTCCGTCGCCATCATGGGCCGCCGCAAGAATGTCCTCGACGGCGCCGTTTCCACCCTCACCTCCCTCGGCATCCCCGCAATTGGAATTCAAGGGGATGTTCGGAAAGTGGAAGATGCAAAACGAGTGGTGGAGGAAACGGTGAGGCATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765244.1
MESPFKSDVLKGKVALLTGGGSGIGFEISTQFGKHGASVAIMGRRKNVLDGAVSTLTSLGIPAIGIQGDVRKVEDAKRVVEETVRHFGKLDILVNAAAGNFLVAAEDLSPNGFKTVMDIDTVGTFTMSHEALKYLKKDTSSSSSSSSSSGGLILNISATLHYTAAWYQIHVSAAKAAIDAMTRNLALEWGTDYDIRVNGIAPGPIGDTAGMSKLLPDEIGNKTREYMPLYKLGEKWDIAMAAVYLASDAGKYINGSILPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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