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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001306`

染色体: Chr05 坐标: 11271009-11281719 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001306`
名称	SmilChr05G001306
描述	nuclear cap-binding protein subunit 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11271009 - 11281719 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986007`
GeneID	`130986007`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986007`
原始查询	`SmilChr05G001306`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear cap-binding protein subunit 1
产物	nuclear cap-binding protein subunit 1
Arabidopsis	`AT2G13540` (ABH1) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815840] identity=65.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0347200` (ABH1) - identity=60.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000184 (nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay); GO:0000339 (RNA cap binding); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005845 (GO:0005845); GO:0005846 (nuclear cap binding complex); GO:0006406 (mRNA export from nucleus)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02854 (MIF4G); PF09088 (MIF4G_like); PF09090 (MIF4G_like_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986007

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765245.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765245.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765245.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765245.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765245.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11273012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr5:11273072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B57,C19
`Chr5:11273429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B59,C38,C82
`Chr5:11273540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B61,B79,B8,C44
`Chr5:11273707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:11273873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B54,C35
`Chr5:11275430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B54,C35
`Chr5:11277333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B51,B52,B62,B81
`Chr5:11277377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:11277390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:11277415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:11277423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765245.1

861 aa

430

861

MIF4G

MIF4G_like

MIF4G_like_2

PF02854 MIF4G 22-196 aa PF09088 MIF4G_like 344-467 aa PF09090 MIF4G_like_2 497-824 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765245.1`	Pfam	`PF02854`	MIF4G	Repeat	22	196	5.3e-25	89.0	MIF4G domain
`XP_057765245.1`	Pfam	`PF09088`	MIF4G_like	Repeat	344	467	3.7e-38	131.9	MIF4G like
`XP_057765245.1`	Pfam	`PF09090`	MIF4G_like_2	Repeat	497	824	1.9e-33	116.8	MIF4G like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909262.1
GAAAGAATTATTCCCGCTCGCCCTTGGGATAAATCGAGTCAGTAAATCGCACGCTAACCCTTCTTCGGTTCCACTGATCTCCCTCGCGCGCCACCGCTTTTTCTCCGGCCCTTTTGAAAAAGTTTGCCTTCTTCCGCCGGCGGAATGAGTAGCTGGAGAAGTCTTGTGCTTCGAATTGGAGAGAAATGCGCCGAGTACGGCGGGAATACCGATTACAGAGACCAACTCGAGACCTGCTTTGGCGTGGTTCGACGTGAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986007
ATGAGTAGCTGGAGAAGTCTTGTGCTTCGAATTGGAGAGAAATGCGCCGAGTACGGCGGGAATACCGATTACAGAGACCAACTCGAGACCTGCTTTGGCGTGGTTCGACGTGAACTGCCGCATTCCCAAGATGATATTTTATCGTTCCTTCTCCAGTGTGCGGAACAGTTGCCTCACAAGATACCCCTTTATGGAACACTGGTTGGGCTGCTAAATTTGGAAGATGAAGATTCGGTCAAGAGAATTTTGGAGGATACACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765245.1
MSSWRSLVLRIGEKCAEYGGNTDYRDQLETCFGVVRRELPHSQDDILSFLLQCAEQLPHKIPLYGTLVGLLNLEDEDSVKRILEDTHGNLQVALDSGSCNRIRILMRFLTALMCSKVLQPSSLVVLFETMLSSAATTVDEDKGNPSWQACADFYITCILSCLPWGGAELVEQVPEEIDRVMVGIQAYMSIRRHVTDAGCSAFEHIDDRSQDDGGKDFLEDLWSRIQDLSSKAWKLDSVPRPHLPFEPQLVAGKSHDFGSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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