当前解析结果
SmilChr05G001313| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001313 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001313 |
| 描述 | guanine nucleotide-binding protein-like NSN1 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 11307068 - 11311697 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986012 |
|---|---|
| GeneID | 130986012 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986012 |
| 原始查询 | SmilChr05G001313 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | guanine nucleotide-binding protein-like NSN1 |
| 产物 | guanine nucleotide-binding protein-like NSN1 |
| Arabidopsis | AT3G07050 (NSN1)GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819890] identity=54.8; qcov=0.876; evalue=1.27e-33; confidence=medium |
| Rice | Os01g0375000 (Os_F0781)- identity=46.1; qcov=0.944; evalue=7.93e-28; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986012 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057765250.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765250.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765250.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057765250.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057765250.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:11310254 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B103,B83,C32,C68 |
Chr5:11310305 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B127,B3,B67 |
Chr5:11310403 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr5:11310713 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,C23,C8 |
Chr5:11310768 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr5:11310778 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C24,C83 |
Chr5:11310928 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
10 records
下载 cDNA FASTA9 records
下载 CDS FASTA9 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。