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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001324`

染色体: Chr05 坐标: 11386285-11388080 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001324`
名称	SmilChr05G001324
描述	uncharacterized SmilChr05G001324
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11386285 - 11388080 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986022`
GeneID	`130986022`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986022`
原始查询	`SmilChr05G001324`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	filamentous hemagglutinin transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844257]; symbol=AT1G79160; hit=AT1G79160; species=arabidopsis; confidence=high
产物	filamentous hemagglutinin transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844257]; symbol=AT1G79160; hit=AT1G79160; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G79160` (AT1G79160) filamentous hemagglutinin transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844257] identity=49; qcov=1.09; evalue=7.9e-54; confidence=high
Rice	`Os04g0617700` - identity=47.4; qcov=0.251; evalue=3.15e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24747 (Zn-ribbon_GIR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986022

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765271.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765271.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765271.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765271.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765271.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11386846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B13
`Chr5:11386945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C24,C28
`Chr5:11387479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B20,C62,C80
`Chr5:11387479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,C62,C80
`Chr5:11387559`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A18,A22,B113,B118,B128,B139,B31,B57,B74,B78,B93,C23,C25,C43,C60,C64,C66,D10
`Chr5:11387562`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A18,A22,B113,B118,B128,B139,B31,B57,B74,B78,B93,C23,C25,C35,C43,C60,C64,C66,D10
`Chr5:11387943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C44,C73,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765271.1

233 aa

116

233

Zn-ribbon_GIR1

PF24747 Zn-ribbon_GIR1 191-216 aa

XP_057765272.1

227 aa

114

227

Zn-ribbon_GIR1

PF24747 Zn-ribbon_GIR1 185-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765271.1`	Pfam	`PF24747`	Zn-ribbon_GIR1	Domain	191	216	3.9e-09	37.1	GIR1-like zinc ribbon domain
`XP_057765272.1`	Pfam	`PF24747`	Zn-ribbon_GIR1	Domain	185	210	3.8e-09	37.1	GIR1-like zinc ribbon domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909289.1
GATTAATGCGGCAATAAAAATCATAAACACAAATGGATACAAAATAGAGAAGAAAAAAGCAGTCATTAGCAGAGCATTAATGGCTTATCTAAGGAAGCCAAAAGGTCTTTGTATTGTGCGTAGCATTAATTCACAGCTGTCCTTTTGTGTTCCTCTTCTCTCTGCATTTATTGCCCCCCAATCTCAACTCAAACCATTTTCTCTTATAATTATTACTCCTTATTGAATCAAAAATACCACTCATACTATTCAAAATGCCA...

XM_057909288.1
GCATTAATGGCTTATCTAAGGAAGCCAAAAGGTCTTTGTATTGTGCGTAGCATTAATTCACAGCTGTCCTTTTGTGTTCCTCTTCTCTCTGCATTTATTGCCCCCCAATCTCAACTCAAACCATTTTCTCTTATAATTATTACTCCTTATTGAATCAAAAATACCACTCATACTATTCAAAATGCCATCAAATATAATATTATAGCTTTCCCATATATATCCGTATAAAATCAAGATTTCATTAAATTCTTCATTATGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986022
ATGGCCGCTGATGTCAGTTCCTTGGTCAGATTGATCAACGCCGGCGATGCTGCTGATTCTCCCAAACCCACGCCTCCGATCACCCGCGACTTGCTCGCCGGATGTACAACCCTTGATTCTAAGGAGTTGGACCTCGACTTGCAAGTCCCCTGCGGCTGGGAGAAGCGCCTCGACCTAAAGCTATTAATTGATGTGCAGTCAGGAAAAGTGTATCTGCAGAGATGCAATTCGTCAAACTCTTCATCATCAAGCACAGAGAA...

LOC130986022
ATGGCCGCTGATGTCAGTTCCTTGGTCAGATTGATCAACGCCGGCGATGCTGCTGATTCTCCCAAACCCACGCCTCCGATCACCCGCGACTTGCTCGCCGGATGTACAACCCTTGATTCTAAGGAGTTGGACCTCGACTTGCAAGTCCCCTGCGGCTGGGAGAAGCGCCTCGACCTAAAGTCAGGAAAAGTGTATCTGCAGAGATGCAATTCGTCAAACTCTTCATCATCAAGCACAGAGAAGAAGGGTGAAGAAAGCGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765271.1
MAADVSSLVRLINAGDAADSPKPTPPITRDLLAGCTTLDSKELDLDLQVPCGWEKRLDLKLLIDVQSGKVYLQRCNSSNSSSSSTEKKGEESGGKFQDLNFPPSSKQTLNLLDEEGLELKLVSGSPLSSPYQSVCTLDKVKSALERAEKETVRKRSSISMSKSSSLPSNSSSSIKDSDLDQEERSSSSFAAGCPTCLLYVLISTTNPKCPRCNSNVPMPLPAKKPRIDLNISI

XP_057765272.1
MAADVSSLVRLINAGDAADSPKPTPPITRDLLAGCTTLDSKELDLDLQVPCGWEKRLDLKSGKVYLQRCNSSNSSSSSTEKKGEESGGKFQDLNFPPSSKQTLNLLDEEGLELKLVSGSPLSSPYQSVCTLDKVKSALERAEKETVRKRSSISMSKSSSLPSNSSSSIKDSDLDQEERSSSSFAAGCPTCLLYVLISTTNPKCPRCNSNVPMPLPAKKPRIDLNISI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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