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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001339`

染色体: Chr05 坐标: 11814162-11814671 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001339`
名称	SmilChr05G001339
描述	uncharacterized SmilChr05G001339
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11814162 - 11814671 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025515`
GeneID	`131025515`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025515`
原始查询	`SmilChr05G001339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07470` (AT3G07470) transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935] identity=52.4; qcov=0.609; evalue=4.09e-32; confidence=medium
Rice	`Os01g0913100` - identity=47.5; qcov=0.698; evalue=1.03e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025515

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057811291.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057811291.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057811291.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057811291.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11814188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B24,B71,C58
`Chr5:11814204`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	49	A10,A24,A25,A6,A7,B1,B113,B114,B118,B128,B132,B135,B15,B19,B21,B24,B28,B33,B4,B41,B55,B58,B64,B65,B7,B72,B8,B97,B99,C10,C13,C18,C20,C21,C24,C3,C33,C34,C38,C39,C44,C5,C53,C54,C61,C77,D10,D11,D5
`Chr5:11814205`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B105,B107,B123,B25,B59,C9
`Chr5:11814231`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B1
`Chr5:11814231`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B1
`Chr5:11814240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B114,B54,C61
`Chr5:11814262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr5:11814273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A20,A21,B101,B129,B50,C32,C65,C68,C72,C83,D11
`Chr5:11814303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B68,C48
`Chr5:11814306`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	94	A14,A16,A18,A2,A22,A23,A25,A3,A4,A8,A9,B1,B101,B106,B119,B121,B123,B125,B130,B132,B134,B137,B138,B140,B16,B17,B18,B19,B21,B24,B26,B29,B33,B36,B38,B40,B41,B46,B50,B51,B6,B63,B65,B68,B69,B70,B71,B72,B73,B75,B77,B8,B9,C1,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C25,C26,C27,C32,C36,C37,C4,C41,C42,C47,C49,C51,C53,C57,C6,C60,C61,C65,C7,C70,C72,C73,C74,C78,C80,C81,C84,C86,D10,D2,D4,D5
`Chr5:11814354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:11814360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B88,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811291.1

169 aa

169

DUF538

PF04398 DUF538 48-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811291.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	48	145	4.3e-20	73.0	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955308.1
ATGGTGTTGCGCAATCCAATGAAAATGGCGATGCTCCTCATCACCGCAAATAACCCTAGCTATGGCGGAAGAAAATCCGCACCCCAAATCAGCGCAGCTGGTGACGTTTTACGACATCCTAAGCTCACACGGCCTCTCCATCGGCTATTCCCCAAAAGCATCTTCGGTTTCTCCATCGACCCCGCATCCGGCGGTTTCCGCCTCTGCTTGCCGTCTCCTTCGCCGTGCGACACCGTGTTCGAGACCCACCTCCGGTATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025515
ATGGTGTTGCGCAATCCAATGAAAATGGCGATGCTCCTCATCACCGCAAATAACCCTAGCTATGGCGGAAGAAAATCCGCACCCCAAATCAGCGCAGCTGGTGACGTTTTACGACATCCTAAGCTCACACGGCCTCTCCATCGGCTATTCCCCAAAAGCATCTTCGGTTTCTCCATCGACCCCGCATCCGGCGGTTTCCGCCTCTGCTTGCCGTCTCCTTCGCCGTGCGACACCGTGTTCGAGACCCACCTCCGGTATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811291.1
MVLRNPMKMAMLLITANNPSYGGRKSAPQISAAGDVLRHPKLTRPLHRLFPKSIFGFSIDPASGGFRLCLPSPSPCDTVFETHLRYEYDITGRINYGRISNLTGILAQDLFLWLPTKGIQVDIPSSGLIYFDVEVVSKQFSLSLFDTLKNCSSAEDVDGYGDLLKIPQV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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