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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001340`

染色体: Chr05 坐标: 11815979-11817212 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001340`
名称	SmilChr05G001340
描述	transcription factor JUNGBRUNNEN 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11815979 - 11817212 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986038`
GeneID	`130986038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986038`
原始查询	`SmilChr05G001340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor JUNGBRUNNEN 1-like
产物	transcription factor JUNGBRUNNEN 1-like
Arabidopsis	`AT2G43000` (NAC042) NAC domain containing protein 42 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818902] identity=54.6; qcov=0.978; evalue=3.35e-90; confidence=high
Rice	`Os03g0777000` (ONAC066) - identity=67.4; qcov=0.664; evalue=3.36e-81; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765285.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765285.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765285.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765285.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11816141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B33,B68,C24,C48
`Chr5:11816195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr5:11816523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C82
`Chr5:11816527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:11816902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765285.1

268 aa

134

268

NAM

PF02365 NAM 24-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765285.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	24	148	2.2e-46	158.0	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909302.1
AAAGGTGAACCTCAAGTACCAATAGTTCCTTTCACATAGAAAATTCAACGATAAGAAAAAGGTGATCGATTGGAAGTACATATATATATATATATATCTGTGGAAAATTAAAGTAATAGAGTAATTAGTGATGGAAGTGGAAAACATGAGCAGCCCAATCTCGTGTGGTAGTAAGGAAGAGGAGGAAGACGCAGAGCTTCCCGGTTTCCGGTTTCACCCGACAGACGAAGAGCTGGTGGGGTTCTATCTCCGGCGGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986038
ATGGAAGTGGAAAACATGAGCAGCCCAATCTCGTGTGGTAGTAAGGAAGAGGAGGAAGACGCAGAGCTTCCCGGTTTCCGGTTTCACCCGACAGACGAAGAGCTGGTGGGGTTCTATCTCCGGCGGAAGGTGGAGAAGCGGCCCATCCGCCTCGACCTCATCAAGCACGTCGAAATCTACAAATTCGATCCCTGGGATCTTCCAAAGTCGAACGGCGCAGGGGAGAAAGAGTGGTACTTCTTCTGCAGAAGAGGGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765285.1
MEVENMSSPISCGSKEEEEDAELPGFRFHPTDEELVGFYLRRKVEKRPIRLDLIKHVEIYKFDPWDLPKSNGAGEKEWYFFCRRGKKYKNSLRPNRVTRSGFWKATGIDRPIYSSRRDCIGLKKSLVYYRGSAGKGTKTDWMMHEFRLPTSDSKQEAEVWTLCRILKRSASYRKCVPVPVPVEMKRSASSETCSLESCDQNGGSYISFTAPLATHQTSVQPHFITSSSSSTYTMYSDINEFLRHADWEDLRSVVDSAAAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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