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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001347`

染色体: Chr05 坐标: 11917258-11918783 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001347`
名称	SmilChr05G001347
描述	probable BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11917258 - 11918783 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986044`
GeneID	`130986044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986044`
原始查询	`SmilChr05G001347`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 3
产物	probable BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 3
Arabidopsis	`AT3G12920` (BRG3) SBP (S-ribonuclease binding protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820477] identity=46.6; qcov=1.12; evalue=2.12e-89; confidence=high
Rice	`Os03g0263800` - identity=39.4; qcov=0.637; evalue=5.4e-36; confidence=medium
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0043067 (regulation of programmed cell death)
KEGG	-
Pfam	PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765298.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765298.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765298.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765298.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765298.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11917859`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr5:11917859`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr5:11917862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:11917963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr5:11918571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:11918600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765298.1

303 aa

152

303

zf-C3HC4_3

PF13920 zf-C3HC4_3 251-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765298.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	251	292	1.3e-09	38.4	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909315.1
GTATTCCGGAATAGCCCCTCGCAATTAGCCGGAAATACGACCTCATCTATCATATTATGACGCCCCCTTTCTGCTTAACCCAACAAACAAATCTCTCTCTTTCTCTCTCCCAAACCACTTTTAATGCCAAACCCCTTAATAAACCCCACCCCACCCCTCCCATTTGCATTTGCGTATATATTTGGTTGCCCCCTCCTCCATCTCACTTTGCTTTTCATTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAAAACCAATTTAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986044
ATGGCCGTCGAAGCTCGCCATCTCAATCTCTTTCCTCCGCAGATTCTCGGCAATAGAGGGCTGATGATCAACGGTGTGGAAGGCATTGGAAACGCGTACGCCGCGCCGGCCGGATTCGGAATGCTGCCTCCCTTGTCGGGGACCACGACGGCGACCGAGACTATGGGCCCCATGTACTGTTCGGCGATTACAGAAACCGTCCTCGCCAAAACGTCCGCGATTAAGTCCGACAGCGGCCTCACGTACGCCGCCGTCCCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765298.1
MAVEARHLNLFPPQILGNRGLMINGVEGIGNAYAAPAGFGMLPPLSGTTTATETMGPMYCSAITETVLAKTSAIKSDSGLTYAAVPVSRKRSRDAINPMMSSSLPTANNRRGSLTFLGEDFSLHFQQQQLEMDRFITQHTEKVRIEIEERRKKYARRIAAAVQENILKKLKAKEEEVEKIGKMNCALEERVKSLCVENQIWRDLAQANEATANALRCNLEQVLAQVQDEQQEQGGDDGQSCCGSNYEEEDGRMCRSCGKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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