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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001380`

染色体: Chr05 坐标: 12307303-12308920 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001380`
名称	SmilChr05G001380
描述	uncharacterized SmilChr05G001380
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12307303 - 12308920 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986073`
GeneID	`130986073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986073`
原始查询	`SmilChr05G001380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836536]; symbol=AT5G64150; hit=AT5G64150; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836536]; symbol=AT5G64150; hit=AT5G64150; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G64150` (AT5G64150) RNA methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836536] identity=60.1; qcov=0.903; evalue=1.7e-136; confidence=high
Rice	`Os12g0612500` - identity=51.1; qcov=0.878; evalue=6.91e-92; confidence=high
GO	GO:0006479 (protein methylation); GO:0008276 (protein methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05175 (MTS); PF06325 (PrmA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057765332.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057765332.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765332.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765332.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765332.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12307732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:12307738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:12307862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,D7
`Chr5:12307868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B11,D7
`Chr5:12308223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:12308254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765332.1

361 aa

180

361

MTS

PrmA

PF05175 MTS 189-271 aa PF06325 PrmA 193-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765332.1`	Pfam	`PF05175`	MTS	Domain	189	271	3.8e-07	30.5	Methyltransferase small domain
`XP_057765332.1`	Pfam	`PF06325`	PrmA	Family	193	244	1.4e-05	25.5	Ribosomal protein L11 methyltransferase (PrmA)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909349.1
ATTTAATGAAGGCGTGTGTACAGCACACGCCAAATAGTAGAGCCATCGTGCATACCCGTTCTATTGGGTAACACTCGAGTAGAGCCCCTTTGCATCGGCGCCCTACTCCAACTCCACAATTGATGTTGCGGTCTTTCACTGTTACCACTACCCTATTCCATCATAGCATTCAATTTGGAGACAAATGAAATCAAGGCCAGACCATCCTCTTCGAAGGATTCCAATATTCGACGCAAACGAGTATATCTTTTTGCGTGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986073
ATGAGCAAGGCCCGGCCCAAAGAACCTCAAACGATGAGGTCCAGTCGTGCGTCTCTCTCCTCTATACTCCAACCCGTCTTCTCGCTGCGCCCCAAATCCTTCTGCTCCGCCGCGCCGCCCAAGCACAAGCACAAGCCCCAGACTCCCCTCCACCTTCGCCCCCCGGCCTTCCGCGTCACCCTCTCCGACCTCAAGCAATGGCACGCATGGGCCAAAACCCAGGCCTCCTCCGTGGGCTCCACTTTCTCGGCCCTCGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765332.1
MSKARPKEPQTMRSSRASLSSILQPVFSLRPKSFCSAAPPKHKHKPQTPLHLRPPAFRVTLSDLKQWHAWAKTQASSVGSTFSALDGGPDSDLLLRELKWLVEDAVEHPALLDGGGAAQVAIRARLEELYELWRQRIQERRPFQYVVGCEHWRDLILSVEEGVLIPRPETETIVDLVGDAVKADGELREGLWADLGTGSGALAIAVARVLGGGGRVVAVDLSSIAAAVAGYNVERYCLQGKVSVRVGSWFEGVEGELRGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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