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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001387`

染色体: Chr05 坐标: 12447875-12452029 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001387`
名称	SmilChr05G001387
描述	COP9 signalosome complex subunit 6a
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12447875 - 12452029 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986080`
GeneID	`130986080`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986080`
原始查询	`SmilChr05G001387`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COP9 signalosome complex subunit 6a
产物	COP9 signalosome complex subunit 6a
Arabidopsis	`AT5G56280` (CSN6A) COP9 signalosome subunit 6A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835727] identity=80.1; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0500000` (CSN6) - identity=78.9; qcov=1.02; evalue=3.59e-180; confidence=high
GO	GO:0000338 (protein deneddylation); GO:0005515 (protein binding); GO:0008180 (COP9 signalosome); GO:0008237 (metallopeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01398 (JAB); PF13012 (MitMem_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986080

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765339.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057765339.1`
3	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057765339.1`
4	Midbody	Midbody	0.40000	`XP_057765339.1`
5	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057765339.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12448943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr5:12450169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:12450221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765339.1

296 aa

148

296

JAB

MitMem_reg

PF01398 JAB 7-114 aa PF13012 MitMem_reg 163-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765339.1`	Pfam	`PF01398`	JAB	Domain	7	114	9.5e-24	84.2	JAB1/Mov34/MPN/PAD-1 ubiquitin protease
`XP_057765339.1`	Pfam	`PF13012`	MitMem_reg	Family	163	277	2.2e-31	108.7	Maintenance of mitochondrial structure and function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909356.1
ACTCTAAAAATAACAACAGAGAATAAATAGAAAAAGCGAACTCTGCAAACCCTTCAAATTATAACCGTAGTTTTTCCGATATCAATCAATCAAAGGGGGGAGAAAGAGAGAGAAGATGGCGTCGTCGTCGAGCAGCGGGCTTACCTTCAAGCTCCACCCTCTCGTCATTGTCAACATCTCCGATCACTTCACTCGAGTGAAGTCCCAGTCTCATCCGCGTCGTGTAGTCGGTTGCGTCATCGGCGTCCAGCGCGGCCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986080
ATGGCGTCGTCGTCGAGCAGCGGGCTTACCTTCAAGCTCCACCCTCTCGTCATTGTCAACATCTCCGATCACTTCACTCGAGTGAAGTCCCAGTCTCATCCGCGTCGTGTAGTCGGTTGCGTCATCGGCGTCCAGCGCGGCCGCACCGTTGAGATCTTCAACAGTTTTGAGCTTCTCTACGACGACTCCACCCACTCGCTCGACCGCGCATTTCTCGAGAAAAAGCAAGAGCTATATAAGAAGGTTTTTCCGCAATTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765339.1
MASSSSSGLTFKLHPLVIVNISDHFTRVKSQSHPRRVVGCVIGVQRGRTVEIFNSFELLYDDSTHSLDRAFLEKKQELYKKVFPQFYILGWYSTGSDAQESDMIIHKSLMNINESPVYVLLNPSINPAQKDLPVTIYESELHVIDGNPQLIFVQSSYTIETVEAERISVDHVAHLKPSDGGSAATQLAAHLTGIHSAIKMLNSRIRVLHHYLLAMQKGDIPCENSLLRQVSSLLRRLPAIESEKFQDDFLMEYNDTLLIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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