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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001409`

染色体: Chr05 坐标: 12698914-12704047 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001409`
名称	SmilChr05G001409
描述	KH domain-containing protein At5g56140
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12698914 - 12704047 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986100`
GeneID	`130986100`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986100`
原始查询	`SmilChr05G001409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	KH domain-containing protein At5g56140
产物	KH domain-containing protein At5g56140
Arabidopsis	`AT5G56140` (AT5G56140) RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835713] identity=74.2; qcov=1; evalue=1.88e-150; confidence=high
Rice	`Os02g0722700` - identity=74.8; qcov=1.01; evalue=1.59e-149; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0048024 (regulation of mRNA splicing, via spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF16544 (STAR_dimer); PF22675 (KH-I_KHDC4-BBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986100

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765366.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765366.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057765368.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057765366.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057765366.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12699390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:12699450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C2
`Chr5:12699519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:12699674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:12700710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C58
`Chr5:12703651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C58,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765366.1

295 aa

148

295

STAR_dimer

KH-I_KHDC4-BBP

PF16544 STAR_dimer 39-76 aa PF22675 KH-I_KHDC4-BBP 156-243 aa

XP_057765368.1

294 aa

147

294

STAR_dimer

KH-I_KHDC4-BBP

PF16544 STAR_dimer 39-76 aa PF22675 KH-I_KHDC4-BBP 155-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765366.1`	Pfam	`PF16544`	STAR_dimer	Domain	39	76	1.7e-07	31.3	Homodimerisation region of STAR domain protein
`XP_057765366.1`	Pfam	`PF22675`	KH-I_KHDC4-BBP	Domain	156	243	5e-19	68.7	KHDC4/BBP-like, KH-domain type I
`XP_057765368.1`	Pfam	`PF16544`	STAR_dimer	Domain	39	76	8.2e-10	38.8	Homodimerisation region of STAR domain protein
`XP_057765368.1`	Pfam	`PF22675`	KH-I_KHDC4-BBP	Domain	155	242	5e-19	68.7	KHDC4/BBP-like, KH-domain type I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909385.1
CAGAAATTCCAAATATTATCAAATTCTAATTTAACAATTAAATAATATAGAAGCGTGAGGAAATAGTTACAGCGAATAAGCGCACAGTAAAAACTAAAAACAATAATTGGCCGTGGCTCTGCAGCATTGGCATTGGGCCTCTCTCTCATCTCAATCTCATCTCATCTCATCACTTCAATAAATACACACTTCTCCTTCACAATCTCCTCCCCTTTTTTGCTTTTTGCTCCACCGACGCACCGTTTGTATTCATCTCCACC...

XM_057909383.1
TTGGGCCTCTCTCTCATCTCAATCTCATCTCATCTCATCACTTCAATAAATACACACTTCTCCTTCACAATCTCCTCCCCTTTTTTGCTTTTTGCTCCACCGACGCACCGTTTGTATTCATCTCCACCATAAATCATCATCCAGCAGCTCTTGAGTTGGACTGGCGGTTCGGTCTCCCTTTGCTGGATCTGACGGCGATCATAATCGCCGCTGCCGGTGTACCATGTCGTCCGGGAGGTACATGGTCTACTCGCCGTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986100
ATGTCGTCCGGGAGGTACATGGTCTACTCGCCGTCTCCGTCCGCCCCTCACTCTCCTCACATCGGCGCACCCGCGGCCGGCGGTGGTCTCCGCGCCGCCTCTGCTCTCGCCGAACAAGAAAAGTACCTCTCAGAATTGCTGGCAGAACGCAACAAGCTCAATCCTTTTATGGCTGTTCTACCAAATTGCTACCGGTTGCTGAATCAGGAAATATTGCGTGTAACTACACTGTTGGGGAGTGCATCAGTTTTAGAACAAAG...

LOC130986100
ATGTCGTCCGGGAGGTACATGGTCTACTCGCCGTCTCCGTCCGCCCCTCACTCTCCTCACATCGGCGCACCCGCGGCCGGCGGTGGTCTCCGCGCCGCCTCTGCTCTCGCCGAACAAGAAAAGTACCTCTCAGAATTGCTGGCAGAACGCAACAAGCTCAATCCTTTTATGGCTGTTCTACCAAATTGCTACCGGTTGCTGAATCAGGCAGAAATATTGCGTGTAACTACACTGTTGGGGAGTGCATCAGTTTTAGAACA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765366.1
MSSGRYMVYSPSPSAPHSPHIGAPAAGGGLRAASALAEQEKYLSELLAERNKLNPFMAVLPNCYRLLNQAEILRVTTLLGSASVLEQSVLEHASPLASGGMYSNGGANVNRWASPFQSEMSSLMQSSSTPNWLGSQGSSSGLIVKRTIRVDIPVDQYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEATTECRVLIRGRGSIKDPTREEMMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQSREILEDLLKPMDESQDYYKKQQLRE...

XP_057765368.1
MSSGRYMVYSPSPSAPHSPHIGAPAAGGGLRAASALAEQEKYLSELLAERNKLNPFMAVLPNCYRLLNQEILRVTTLLGSASVLEQSVLEHASPLASGGMYSNGGANVNRWASPFQSEMSSLMQSSSTPNWLGSQGSSSGLIVKRTIRVDIPVDQYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEATTECRVLIRGRGSIKDPTREEMMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQSREILEDLLKPMDESQDYYKKQQLREL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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