当前解析结果
SmilChr05G001411| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001411 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001411 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G001411 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 12746997 - 12748203 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986102 |
|---|---|
| GeneID | 130986102 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986102 |
| 原始查询 | SmilChr05G001411 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | RNA polymerase II elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835711]; symbol=AT5G56120; hit=AT5G56120; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | RNA polymerase II elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835711]; symbol=AT5G56120; hit=AT5G56120; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G56120 (AT5G56120)RNA polymerase II elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835711] identity=54.2; qcov=1.1; evalue=6.81e-76; confidence=high |
| Rice | Os08g0496600- identity=47.5; qcov=1.11; evalue=1.85e-48; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986102 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057765372.1 |
| 2 | Endosome | 内体 | 0.60000 | XP_057765372.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057765372.1 |
| 4 | Endosome membrane | 内体膜 | 0.40000 | XP_057765372.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057765372.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:12747624 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A20,B117,D2 |
Chr5:12747624 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A20,B117,D2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。