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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001420`

染色体: Chr05 坐标: 12869376-12870318 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001420`
名称	SmilChr05G001420
描述	chaperone protein dnaJ 11, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12869376 - 12870318 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986112`
GeneID	`130986112`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986112`
原始查询	`SmilChr05G001420`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ 11, chloroplastic
产物	chaperone protein dnaJ 11%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G13310` (AT3G13310) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820531] identity=54.5; qcov=0.826; evalue=3.54e-28; confidence=medium
Rice	`Os03g0244950` - identity=42.9; qcov=0.846; evalue=3.51e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986112

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765386.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057765386.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765386.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765386.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765386.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12869836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B33,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765386.1

149 aa

149

DnaJ

PF00226 DnaJ 42-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765386.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	42	110	3.2e-18	66.3	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909403.1
TACACCGAGACGATGGTTCGAATATTTATTATTATTATTATTATTCATGTAAATTTATTTTAAAATATAAAAATAATATGGCCTATTGAGGAAATGGGCAATGGCATAATGGAGTAATGAAAAGAAGTTAGTGAAAAAGGTAATCCAGCCAATTACTCCAACCAAAACCAATCCAATGTGCCAAGTCAGCACACAGTAAAGTCACACACATTCTGACTTCCATATAAACCCTTCATCTCTCATTGTTTCTCGCCACACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986112
ATGCTTCGAAACCCTACGCTCGCCTTCAAACAATCCCTTCCTTTCCACCAATTCCGCAGCCGGAACATGTCCGTGCGAGCCGAGCTGGCGCAGCTGGCCGTGGCGGCGCCTGATCGCCGGAGCCTCTACGAGGTCCTCCGCGTCAAGCGGAACGCATCGCAGGTGGAGATCAAGACGGCCTACCGCACGCTCGCCAAGCTGCACCATCCCGACGCCAGGGCGCGATTTATGGATTCCTCGATCGCATCGTCCGCGGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765386.1
MLRNPTLAFKQSLPFHQFRSRNMSVRAELAQLAVAAPDRRSLYEVLRVKRNASQVEIKTAYRTLAKLHHPDARARFMDSSIASSADGGDFIEIHNAYATLSDPNARAEYDLNLTVDSRGRWNPAGVSGYRSPGRARFYQTRRWETDQCW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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