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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001421`

染色体: Chr05 坐标: 12871223-12880822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001421`
名称	SmilChr05G001421
描述	enhancer of mRNA-decapping protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12871223 - 12880822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986111`
GeneID	`130986111`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986111`
原始查询	`SmilChr05G001421`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	enhancer of mRNA-decapping protein 4-like
产物	enhancer of mRNA-decapping protein 4-like
Arabidopsis	`AT3G13300` (VCS) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820530] identity=56.1; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0300800` (OsWD40-128) - identity=48; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000932 (P-body); GO:0005515 (protein binding); GO:0031087 (deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40); PF16529 (Ge1_WD40); PF21289 (EDC4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986111

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057765385.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057765385.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057765385.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057765385.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.40000	`XP_057765385.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12871494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr5:12871517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr5:12872537`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr5:12872537`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6
`Chr5:12873028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:12873075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B54,C84
`Chr5:12873151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:12873812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:12873970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:12874011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C31,C82
`Chr5:12875224`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B138
`Chr5:12875224`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765385.1

1433 aa

716

1433

Ge1_WD40

WD40

EDC4_C

PF16529 Ge1_WD40 251-562 aa PF00400 WD40 303-330 aa PF00400 WD40 419-449 aa PF21289 EDC4_C 1302-1404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765385.1`	Pfam	`PF16529`	Ge1_WD40	Repeat	251	562	2.4e-17	63.6	WD40 region of Ge1, enhancer of mRNA-decapping protein
`XP_057765385.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	303	330	3.9e-11	43.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765385.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	419	449	3.9e-11	43.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765385.1`	Pfam	`PF21289`	EDC4_C	Repeat	1302	1404	2.1e-20	73.4	Enhancer of mRNA-decapping protein 4, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909402.1
GTGAAAAAACAATAATATTTGTGAATCCATCTTCTTAATTTGGTCGCTAAAAAGTCTCTCCTCACTACCACTCCACCCCACCCCACCCCCATACCCCTCCCTCGCGCATCGGCGCTGCTCCCAATTCCTTCATCGGATCTCTCCCGATTTCTCACTATTTTAATCCACTCCTCAATCAATCTATACGTACACGATAGATATAGATGAACGCTGCTCTCAATCGACCGGAAAATCGTTTAGATCGTTCCCCCTCAGATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986111
ATGGCTTCCCCTGGCAATCCCAACGCACCAGGCGGAGGTCCCTTCGATATGCACAAATTGTTCAAGCCCTCTACACCGCCGCCGCAGCAGCAGCCCACCTCCATCCCCACTTCCAACCCTAATCCTCAGAGCTTCCCCAATAACGTTAGCAATACTAATACTAACCCTAATTTGGTTTCCGCCCCTTTCCCGGTCCCGTCGGCCTCGTATCCGCCGCCCACCGGCACCGGAAGTGGGCCCTACTCCTATTCCCCCCAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765385.1
MASPGNPNAPGGGPFDMHKLFKPSTPPPQQQPTSIPTSNPNPQSFPNNVSNTNTNPNLVSAPFPVPSASYPPPTGTGSGPYSYSPQTSPYHYHPVYTPYSNPPPPPHQEFANVHPQRSMSYPTPPLQPQLQAPNSPHHNNFQNPPNPQNPNNPGARLMALLSAPPSTLEVPQQLTMPMAQIHPTSSTGSDFSMPQNVNVLPSGQGIAVSHQGPVMRMPSSKLPKGRHLIGNHLVYDIDVRLPGEVQPQLEVTPITKYGSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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