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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001438`

染色体: Chr05 坐标: 13135547-13138234 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001438`
名称	SmilChr05G001438
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 41-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13135547 - 13138234 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986129`
GeneID	`130986129`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986129`
原始查询	`SmilChr05G001438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 41-like
产物	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 41-like
Arabidopsis	`AT1G55790` (AT1G55790) ferredoxin-fold anticodon-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842028] identity=54.5; qcov=0.605; evalue=1.51e-75; confidence=high
Rice	`Os09g0479300` - identity=50; qcov=0.573; evalue=7.84e-68; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0070042 (rRNA (uridine-N3-)-methyltransferase activity); GO:0070475 (rRNA base methylation)
KEGG	-
Pfam	PF10354 (BMT5-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986129

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765397.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057765397.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057765397.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057765397.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765397.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13135809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B58,C58,C75,C8
`Chr5:13135910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B3,B59,C38
`Chr5:13135934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B58,C58,C75,C8
`Chr5:13136026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B68,C48
`Chr5:13136043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B119,B23
`Chr5:13136060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B68,C48
`Chr5:13136188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:13136195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C71
`Chr5:13136317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:13136340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13136817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:13136818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C33,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765397.1

349 aa

174

349

BMT5-like

PF10354 BMT5-like 20-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765397.1`	Pfam	`PF10354`	BMT5-like	Domain	20	185	6.1e-51	173.8	rRNA (uridine-N3-)-methyltransferase BTM5-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909414.1
TCTTTATAATTTGATTTTACCGTAAAAAAAAAAAGCACAAAAGTTGCCATGTTTTGCTTAGTAGCTTACCCCTAACCCCAAAACGTGCCTATAAAAATCACATCCTCGATTGCCGGAGTTACCCCTCCGGTTTCCCCCAAATACGCCATTTCCGTCGTAGCAAACCCTGACTAGTCACTACTCAAATAAAATATGAAGACAAAATCTTATAAATATTAGGAGGAAATCGTGAATCCGATCGCGACGTCCGATGGATAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986129
ATGGATAGCGAAGCTAATCAGAGATGGATTAAGTATTATTCATCAGCCCACAATATACTCTTAGTTGGCGAAGGCGACTTCTCATTTTCTCGGTGTTTGGGGATGGCTTTTGGCTCTGCTACTAACATCGTCGCCACTTCTCTCGACTCTTACGATGTATTACTCAACAAATACAAGTCTGCGAAAGACAATTTGGTGAGTTTGGGAAATCTAGGGGCGTCTTTGTTACACGGAGTGGATGCAACCAAAATGATGACTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765397.1
MDSEANQRWIKYYSSAHNILLVGEGDFSFSRCLGMAFGSATNIVATSLDSYDVLLNKYKSAKDNLVSLGNLGASLLHGVDATKMMTHPQLQYKKFHRIIYNFPHAGFQKREDHPVMLMMHRELVRGFLLNASSMLDFDGEIHVRHKTTALFDRWKIEDLGSDCSLVCIAQDEFRIEDYPGYNNKRGSSSRADEPFPLGASKTYRFRLCPVAVNSLIMRKLHLMPQMCTSAPAGVQQQVPMAPFTPQVFSTHPLVVQPQPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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