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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001440`

染色体: Chr05 坐标: 13150479-13151649 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001440`
名称	SmilChr05G001440
描述	uncharacterized protein At4g26485-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13150479 - 13151649 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986131`
GeneID	`130986131`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986131`
原始查询	`SmilChr05G001440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferredoxin-fold anticodon-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842028]; symbol=AT1G55790; hit=AT1G55790; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	ferredoxin-fold anticodon-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842028]; symbol=AT1G55790; hit=AT1G55790; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G55790` (AT1G55790) ferredoxin-fold anticodon-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842028] identity=42.7; qcov=0.953; evalue=4.03e-31; confidence=medium
Rice	`Os09g0479300` - identity=39.7; qcov=0.973; evalue=1.33e-30; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0070042 (rRNA (uridine-N3-)-methyltransferase activity); GO:0070475 (rRNA base methylation)
KEGG	-
Pfam	PF10354 (BMT5-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986131

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765399.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057765399.1`
3	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057765399.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057765399.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13150671`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D6
`Chr5:13150671`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D6
`Chr5:13150702`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B61
`Chr5:13150702`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B61
`Chr5:13150784`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	42	A11,A14,A15,A23,A3,A4,A9,B105,B121,B123,B133,B134,B135,B16,B5,B69,B81,B87,B89,C1,C12,C14,C16,C17,C23,C26,C27,C30,C45,C47,C5,C53,C64,C66,C67,C73,C76,C86,C87,D3,D4,D6
`Chr5:13150855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:13151079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B24,B33,B68,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765399.1

150 aa

150

BMT5-like

PF10354 BMT5-like 2-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765399.1`	Pfam	`PF10354`	BMT5-like	Domain	2	123	6.7e-34	118.3	rRNA (uridine-N3-)-methyltransferase BTM5-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909416.1
CTATTTGAAGCCAAGAAAAGAAGCAGATCCATTCCTCCCAATTCAAAATGAAGCATCAACTGCACTCGGTGAGCCCTTATTACCTCGAATTTGCTCACGCAGGGCTACTGACGATTCACCTTCGCACTCTGTCTTGACAATCACCGTCGATTGTGAAAATGAGAGAGACTCCGTGCCTGAAATCAGATGCTCGAATGGTGAGATTGTAGAAGAAATTGCACAACAAAGAGAAGAAGTGAAGGAGCAAGTAAAGAGGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986131
ATGTCCAACATCGCGGAATTAAAGAGCAGAGGGAGCAAGGTGATGCATGGGATCGATGCAACTGAAATAGCCAAGCATCAATTGCTCCGACAACTCAAATTCGATCGCATAATCTTTAATTTCCCTCATGCTGGATTTTTTTCGAGAGAGTCGACCGAATGTCAGCTTGGGCGTCACAGGAAACTGGTGAGCCAGTTTCTGATGAACGCGAAACAGATGATAAGTGAAAATGGTGAGATTCACATTTCGCACAAGACGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765399.1
MSNIAELKSRGSKVMHGIDATEIAKHQLLRQLKFDRIIFNFPHAGFFSRESTECQLGRHRKLVSQFLMNAKQMISENGEIHISHKTNGFHAQFKVESIASSHGLRLMEAVKFKCGHYPGYNTKYGFGGDKNFNPNPSKTFKFGLKTLPPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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