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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001444`

染色体: Chr05 坐标: 13184673-13187078 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001444`
名称	SmilChr05G001444
描述	fructose-bisphosphate aldolase 5, cytosolic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13184673 - 13187078 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986137`
GeneID	`130986137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986137`
原始查询	`SmilChr05G001444`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fructose-bisphosphate aldolase 5, cytosolic
产物	fructose-bisphosphate aldolase 5%2C cytosolic
Arabidopsis	`AT4G26530` (FBA5) Aldolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828759] identity=87.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0608700` (OsAld-Y) - identity=83.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004332 (fructose-bisphosphate aldolase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0030388 (fructose 1,6-bisphosphate metabolic process)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00030 (Pentose phosphate pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00274 (Glycolytic)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765407.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765407.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765407.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765407.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765407.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13184797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13184852`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B119,B67
`Chr5:13184852`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B119,B67
`Chr5:13184859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B67,B79,C85
`Chr5:13184874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B119,B67,C85
`Chr5:13184883`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B103,B119,B67,C85
`Chr5:13184883`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B103,B119,B67,C85
`Chr5:13184884`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B103,B119,B67,C85
`Chr5:13184884`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B103,B119,B67,C85
`Chr5:13184940`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	143	A1,A13,A14,A15,A16,A23,A24,A3,A4,A6,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B108,B11,B110,B112,B113,B115,B12,B120,B121,B123,B128,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B137,B139,B15,B17,B18,B20,B21,B22,B24,B26,B29,B3,B31,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B46,B48,B5,B52,B53,B55,B57,B58,B62,B63,B64,B65,B68,B69,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B77,B8,B81,B83,B86,B87,B88,B91,B92,B98,B99,C12,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C29,C3,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C5,C50,C51,C57,C58,C59,C60,C62,C63,C64,C65,C68,C69,C7,C72,C74,C76,C77,C78,C8,C81,C86,C87,D1,D2,D3,D6,D7,D8
`Chr5:13184943`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	145	A1,A13,A14,A15,A16,A23,A24,A3,A4,A6,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B108,B11,B110,B112,B113,B115,B12,B120,B121,B123,B128,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B139,B15,B17,B18,B20,B21,B22,B24,B26,B29,B3,B31,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B46,B48,B5,B52,B53,B55,B57,B58,B62,B63,B64,B65,B69,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B77,B8,B81,B83,B86,B87,B88,B91,B92,B98,B99,C11,C12,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C29,C3,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C5,C50,C51,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C68,C69,C7,C72,C74,C76,C77,C78,C8,C81,C86,C87,D1,D10,D2,D3,D6,D7,D8
`Chr5:13184947`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	147	A1,A13,A14,A15,A16,A23,A24,A3,A4,A6,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B108,B11,B110,B112,B113,B115,B119,B12,B120,B121,B123,B128,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B137,B139,B15,B17,B18,B20,B21,B22,B24,B26,B29,B3,B31,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B46,B48,B5,B52,B53,B55,B57,B58,B62,B63,B64,B65,B68,B69,B7,B70,B75,B76,B77,B8,B81,B83,B86,B87,B88,B91,B92,B98,B99,C11,C12,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C29,C3,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C5,C50,C51,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C68,C69,C7,C72,C74,C76,C77,C78,C8,C81,C86,C87,D1,D10,D2,D3,D6,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765407.1

357 aa

178

357

Glycolytic

PF00274 Glycolytic 11-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765407.1`	Pfam	`PF00274`	Glycolytic	Domain	11	357	2.8e-175	582.9	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909424.1
AGAGTGATCACTCGTTCCTTTATCCCAGGACGATAACCTTCGCTGGGCTAATCTTTTGACACGTGTCCATGTTCGAATTTCTTGGAATATTCCGTCAGAGTTGAGCCTATATAAATTGCCTCTCCAGTTTTTGTATATTAGCCTTCTTCCAACTTATCTCGCAGACATATCCATACAACGCAGTCCTAACCATGTCTGCCTTCGTTGGAAAGTATGCTGATGAACTGATGAAGAACGCCAAGTACATAGCGAGCCCAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986137
ATGTCTGCCTTCGTTGGAAAGTATGCTGATGAACTGATGAAGAACGCCAAGTACATAGCGAGCCCAGGCAAGGGCATACTAGCCGCGGACGAGAGCACGGGCACGATCGGGAAGCGGCTGGCGAGCATCAACGTGGAGAACATCGAGTCGAACAGGCAGGCCCTGCGCGAGCTGCTCTTCACGTCCCCCTCGGCCCTCTCCTACCTCTCCGGCGTCATCCTCTTCGAGGAGACCCTCTACCAGAAGACCTCCGACGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765407.1
MSAFVGKYADELMKNAKYIASPGKGILAADESTGTIGKRLASINVENIESNRQALRELLFTSPSALSYLSGVILFEETLYQKTSDGKPFVEVLQENNVIPGIKVDKGTVDLAGTNGETTTQGLDALAARCQQYYKAGARFAKWRSVLKIGPTEPSELSIQQNAQGLARYAIICQENGLVPIVEPEILTDGAHGVNKCAAVTEAVLAAVYKALNDHHVLLEGTLLKPNMVTPGSDSPKVAAEVIAEYTVTALRRTVPPAVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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