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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001479`

染色体: Chr05 坐标: 13565751-13571047 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001479`
名称	SmilChr05G001479
描述	nudix hydrolase 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13565751 - 13571047 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986172`
GeneID	`130986172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986172`
原始查询	`SmilChr05G001479`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 2-like
产物	nudix hydrolase 2-like
Arabidopsis	`AT4G25434` (NUDT10) nudix hydrolase homolog 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828648] identity=61.8; qcov=0.983; evalue=2.02e-74; confidence=high
Rice	`Os06g0634300` - identity=61.2; qcov=0.954; evalue=4.36e-69; confidence=high
GO	GO:0035529 (NADH pyrophosphatase activity); GO:0047631 (ADP-ribose diphosphatase activity); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00760 (Nicotinate and nicotinamide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00293 (NUDIX); PF18290 (Nudix_hydro)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765467.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057765468.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057765467.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765467.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765467.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13566586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B22,B65,B80,B91
`Chr5:13570869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765467.1

272 aa

136

272

Nudix_hydro

NUDIX

PF18290 Nudix_hydro 14-91 aa PF00293 NUDIX 104-221 aa

XP_057765468.1

210 aa

105

210

Nudix_hydro

NUDIX

PF18290 Nudix_hydro 13-91 aa PF00293 NUDIX 104-208 aa

XP_057765469.1

173 aa

173

Nudix_hydro

NUDIX

PF18290 Nudix_hydro 13-91 aa PF00293 NUDIX 104-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765467.1`	Pfam	`PF18290`	Nudix_hydro	Domain	14	91	2.6e-27	95.3	Nudix hydrolase domain
`XP_057765467.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	104	221	2.7e-19	70.2	NUDIX domain
`XP_057765468.1`	Pfam	`PF18290`	Nudix_hydro	Domain	13	91	1.1e-27	96.5	Nudix hydrolase domain
`XP_057765468.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	104	208	4.9e-16	59.7	NUDIX domain
`XP_057765469.1`	Pfam	`PF18290`	Nudix_hydro	Domain	13	91	8.3e-28	96.9	Nudix hydrolase domain
`XP_057765469.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	104	171	1.4e-14	54.9	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909486.1
CAACACAGTGAAAACTCGAGTGTGGGTGGAGCCCAGGGAAGTACGAGCTGGTTGCCGCCACGGCACTTCACGTTATTACCCAAGCCTGACGTCAGCGCATCCACTCGCCACCTTGGGTTTTCTATGGTCCGCGTCCGCGTCACGTTCCTTGCGCTGCAGCCGCACTCTATAAATGGCGGGGCCTTTGCCTCCAACAGCGGCACTCGCATTTACACTGCTCTACATTTTCGATTTTATCATTCAAATTTTTCTGTTGACTT...

XM_057909485.1
AACACAGTGAAAACTCGAGTGTGGGTGGAGCCCAGGGAAGTACGAGCTGGTTGCCGCCACGGCACTTCACGTTATTACCCAAGCCTGACGTCAGCGCATCCACTCGCCACCTTGGGTTTTCTATGGTCCGCGTCCGCGTCACGTTCCTTGCGCTGCAGCCGCACTCTATAAATGGCGGGGCCTTTGCCTCCAACAGCGGCACTCGCATTTACACTGCTCTACATTTTCGATTTTATCATTCAAATTTTTCTGTTGACTTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986172
ATGGATTCTGAAAATGGAATAGAAGATGCCCTAGTGCTTCCTTCGTATGAAGACGAGCATGGAGGTGTCATAGTGGAATTGAAGGAGCCCATGGATCCCACTGATTTTGCTCTCATTCTCAAAACTTCACTTTCACTGTGGAAACTGCAGGGCAAGAAAGGAGTATGGATCAAATTACCAATTGAAATTGTCATTCTTGCTGAAACTGCAGTCAAGGAAGGATTTGTGTATCACCATGCTGAGCCTCAGTATTTGATGCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765467.1
MDSENGIEDALVLPSYEDEHGGVIVELKEPMDPTDFALILKTSLSLWKLQGKKGVWIKLPIEIVILAETAVKEGFVYHHAEPQYLMLVKWISETPSTIPANATHRLRIGAIVLNDKRELLVVLEKHGKFKGTGIWKIPTGIVEEGEDIFVGATREVKEETGVDSEFVDVLAFRQMHETLFQKSDLFFLCTLKPLSFAIQIQESEIDGAQWMAIGEYAAQPFLEQHSVFKFAADICVAKLERGYTGFTPRPTTPFLNHHAT...

XP_057765468.1
MDSENGIEDALVLPSYEDEHGGVIVELKEPMDPTDFALILKTSLSLWKLQGKKGVWIKLPIEIVILAETAVKEGFVYHHAEPQYLMLVKWISETPSTIPANATHRLRIGAIVLNDKRELLVVLEKHGKFKGTGIWKIPTGIVEEGEDIFVGATREVKEETGVDSEFVDVLAFRQMHETLFQKSDLFFLCTLKPLSFAIQIQESEIDGAQV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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