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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001480`

染色体: Chr05 坐标: 13572886-13574652 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001480`
名称	SmilChr05G001480
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13572886 - 13574652 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986171`
GeneID	`130986171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986171`
原始查询	`SmilChr05G001480`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 1
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 1
Arabidopsis	`AT5G55730` (FLA1) FASCICLIN-like arabinogalactan 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835667] identity=64.9; qcov=0.767; evalue=1.67e-141; confidence=high
Rice	`Os09g0248100` (OsFLA11) - identity=49.5; qcov=0.792; evalue=9.7e-90; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057765465.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057765465.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057765465.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765465.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765465.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13573065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B68,C48
`Chr5:13573498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B65,C79
`Chr5:13573509`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A11,A18,A5,B117,B27,B48,B5,B65,B76,C11,C38,C43,C56,C79,D7,D8
`Chr5:13573512`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A11,A18,A5,B117,B27,B34,B48,B5,B65,B76,C11,C38,C43,C56,C79,D7,D8
`Chr5:13573517`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A11,A18,A5,B117,B27,B34,B48,B5,B65,B76,C11,C38,C43,C56,C79,D7,D8
`Chr5:13573543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:13573673`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B34,B65,C39,C49,C50,C56
`Chr5:13573677`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B34,B65,C39,C49,C50,C56
`Chr5:13573680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B115
`Chr5:13573692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B65,C39,C50
`Chr5:13573737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C49
`Chr5:13573825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765465.1

408 aa

204

408

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 197-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765465.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	197	325	6.2e-20	72.4	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909482.1
TAATTTGGTTATCGTCTAAAAAAGTGTCGGCTTCAACTCCAATTATGCGCCGACAGACTAAGCTAATACGGATGACATTATTAACCCAAATCTAATCAACATATTAGTATTTTATTTCTAAATAACTCGCTCTTTTTACAATTTATCATCTACAATCGTCGGTAGTATTTTCGTGACAACATTTAATTCCACATCCCATAAGTTTATTTCTAAAATGCTATAGAATGATTATTTTAAATGATAAAAACATTAAATTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986171
ATGCAGCTCCACCTCGCCGCCGCGGTGGTTCTATCTCTAGCCCTCCTCCTCCCCTCTTCCACCACCGCCCACAACATCACCCGCATTCTGGAGAAAAACCCCGATTTCTCCAGCTTCAACCACTACCTGACCGTCACGCAGCTGGCCCCCGAGATTAACCGCCGCGAGACAATCACCGTGTGCGCGGTGGACAACGCCGGAATGTCGGATCTACTGTCCAAGCACCTCAGCCTGGGAGGCATCAGGAACGTGCTCGCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765465.1
MQLHLAAAVVLSLALLLPSSTTAHNITRILEKNPDFSSFNHYLTVTQLAPEINRRETITVCAVDNAGMSDLLSKHLSLGGIRNVLALHVLLDYFDAKKLHQITDGTALAATMFQATGSATGSAGFVNITDLKGGKVGFAPQDNGGVVSATFVKSVEAIPYNISVIQISSILPSPEAEAPAPGPSQLNITALMSAHGCKVFAETLLANPAEQTFEDNVQSGLTVFCPGDDAMKAFLPKFKNLTAAGKQSLLEYHGIPVYQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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