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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001482`

染色体: Chr05 坐标: 13592649-13593918 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001482`
名称	SmilChr05G001482
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13592649 - 13593918 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986174`
GeneID	`130986174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986174`
原始查询	`SmilChr05G001482`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
产物	nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
Arabidopsis	`AT4G14540` (NF-YB3) nuclear factor Y, subunit B3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827101] identity=85.3; qcov=0.658; evalue=1.7e-75; confidence=high
Rice	`Os03g0413000` (NFYB8) - identity=80.8; qcov=0.638; evalue=1.74e-70; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016602 (CCAAT-binding factor complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765471.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765471.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765471.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765471.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765471.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13593216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B80
`Chr5:13593300`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	C1,C28,C62,D10
`Chr5:13593300`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	C1,C28,C62,D10
`Chr5:13593471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:13593489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B36,B73,C17,D4
`Chr5:13593527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C17
`Chr5:13593539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C17
`Chr5:13593549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C17
`Chr5:13593553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C17
`Chr5:13593555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C17
`Chr5:13593624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B58,B74,C58,C75
`Chr5:13593633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B131,B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765471.1

196 aa

196

CBFD_NFYB_HMF

PF00808 CBFD_NFYB_HMF 28-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765471.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	28	92	1.2e-27	96.7	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909488.1
GGACCTCCACAGACTCCACTTCCATCCCAAACCCCCCCTCTCTTATCTCTCTCTCTACCCTTCTTCCTTCTGTTTTCCGATTTTCCGGTACCGGAATATCCGTTGGAGCTACTTGCCTCCTTTCTTACACTTATCAATTCTTTTTTGCCTCCCTTTTGGAATTCTCATATATTTCAAAACCTGAGTTTTGTCAAGAAATTTTTCCTTTTCTTTTTTCTTTATTTTAGTGAGATGTGTGCAACTTCACAGCGGTGATTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986174
ATGGCGGACTCAGATAATGAGTCTGGAGGGCACCGGGAGCACAATTCGTACCACGAATTGTCCCCTCGGGAGCAGGACAGGTTCCTGCCGATCGCGAACGTGAGCAGAATCATGAAGAAGGCGCTGCCGGCAAACGCCAAAATATCCAAGGACGCGAAAGAGACGGTTCAGGAATGCGTGTCGGAGTTCATCAGTTTCATCACCGGCGAGGCCTCCGACAAGTGCCAGCGCGAGAAGAGGAAAACGATCAACGGCGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765471.1
MADSDNESGGHREHNSYHELSPREQDRFLPIANVSRIMKKALPANAKISKDAKETVQECVSEFISFITGEASDKCQREKRKTINGDDLLWAMTTLGFEDYVEPLKVYLQRFRDLEGEKTAMAGRGEKESGGNGAGVVSMGSGGGGGYEGMYGMNVMSHQGGGAVYGYGQVAGGGKLGSGYHIGSGSGGGGGGSRPR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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