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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001484`

染色体: Chr05 坐标: 13607279-13615171 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001484`
名称	SmilChr05G001484
描述	DEK domain-containing chromatin-associated protein 3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13607279 - 13615171 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986176`
GeneID	`130986176`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986176`
原始查询	`SmilChr05G001484`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEK domain-containing chromatin-associated protein 3
产物	DEK domain-containing chromatin-associated protein 3
Arabidopsis	`AT4G26630` (AT4G26630) DEK domain-containing chromatin associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828770] identity=46.6; qcov=0.777; evalue=1.66e-97; confidence=high
Rice	`Os03g0596900` - identity=40.1; qcov=0.695; evalue=2.47e-76; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006325 (chromatin organization); GO:0042393 (histone binding); GO:2000779 (regulation of double-strand break repair)
KEGG	-
Pfam	PF08766 (DEK_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986176

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765472.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057765472.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057765472.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765472.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13607796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:13608855`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B105
`Chr5:13608855`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B105
`Chr5:13608870`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr5:13608870`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B105
`Chr5:13608910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr5:13609426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13609443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr5:13609538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:13610701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:13610754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B68
`Chr5:13611308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765472.1

685 aa

342

685

DEK_C

PF08766 DEK_C 599-652 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765472.1`	Pfam	`PF08766`	DEK_C	Domain	599	652	1.8e-13	50.9	DEK C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909489.1
CTCATCCGTCCATCACTGCAAATACCAATCTCAGCCGTCAAAGACATGTCAAGTTTTAGAATCCCGCCGAGTGTCTGGCTTCACGATCCGACATGGCATTAAACTGGATTTAAAATCCGAATTTGGTGTCCGCGATATAAAAGGCCAGCCCCAACCATGGAAGTTGTGGGTACCTTTGAAACAGAAATTTTAGAGGGAGAGAGAAGAAAATACCTGTAAAATCGTTTCAGTCTCACACTGAGCTTCCGAAGAAGCTTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986176
ATGGGAGAGGGAGATGTGATATCTGAGAATCCTGAGTCTGTTGCAAATGGAAATGCTGAGGTGGAGGGTGAAGCTGAGACAATTATGGATAAGAAAGGAGAGCATCATGATGGAGTAAAAGAAATGGAAGTAGATAAACATGATGATGGGAAGATTGAGGCTCAGAATATGGATGTGGACAAAGATGATGTCAGCAAATGCGAGGAAATTGATGAAAATGCTGCAAAAGAGGGAAAGGAAGAAACTGCACCGGACAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765472.1
MGEGDVISENPESVANGNAEVEGEAETIMDKKGEHHDGVKEMEVDKHDDGKIEAQNMDVDKDDVSKCEEIDENAAKEGKEETAPDREKEETAAARENEETAGGREKEETAVDREKEETAEDREKKDTAAAVEKEEINYEERGESAEEETGKMDEDKVEEEADGVKEEEENQEEPSKERESKKRSRTKNSAGQKKNNKKVSKEKEEEETRTPYEKKVKEPKTSSHKKEETRASVDKKDKEPKTPAASTIDRPIRERKSVER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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