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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001488`

染色体: Chr05 坐标: 13653868-13654595 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001488`
名称	SmilChr05G001488
描述	uncharacterized SmilChr05G001488
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13653868 - 13654595 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025538`
GeneID	`131025538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025538`
原始查询	`SmilChr05G001488`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=26.5; qcov=0.872; evalue=2.85e-11; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=25.9; qcov=0.872; evalue=1.49e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811313.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811313.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057811313.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811313.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811313.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13653983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:13654190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C21,C31
`Chr5:13654213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:13654219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C50
`Chr5:13654303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr5:13654335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B73,C47,C73
`Chr5:13654341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C73
`Chr5:13654344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B115,B93,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811313.1

195 aa

195

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 32-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811313.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	32	126	1.6e-17	64.7	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955330.1
ATGGAAAGGGGAAATTTGAGACAAATCTCAAAGTTGGTGTATCATGCAGGAGAAACTGATGGATGGACATGGAAGGAGAATAAAGATGGCATATATACAACAAAATCTGCTTACTCTTGCTTGCAGGCAGAAAGGAAAGACGGCACGGAAGCAAATGACAGTTCGAAGACAGCGGCGATGGTGTGGGATGCCCCAGCTTTACAAAAAGCTAAAGTGACAGCTTGGCGAGCGCTTCGGAAGAGACTCCCCACGTGTGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025538
ATGGAAAGGGGAAATTTGAGACAAATCTCAAAGTTGGTGTATCATGCAGGAGAAACTGATGGATGGACATGGAAGGAGAATAAAGATGGCATATATACAACAAAATCTGCTTACTCTTGCTTGCAGGCAGAAAGGAAAGACGGCACGGAAGCAAATGACAGTTCGAAGACAGCGGCGATGGTGTGGGATGCCCCAGCTTTACAAAAAGCTAAAGTGACAGCTTGGCGAGCGCTTCGGAAGAGACTCCCCACGTGTGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811313.1
MERGNLRQISKLVYHAGETDGWTWKENKDGIYTTKSAYSCLQAERKDGTEANDSSKTAAMVWDAPALQKAKVTAWRALRKRLPTCDNLRRRNIVIDDVEMNCNACFSPVETVDHTLLHCPKASAVWDGIMRWIGLQSVRPQGLEAHFLSFSQLGNGKKCTKFLKSLWVCTIWILWRQRNASRFEASDFGISGTSF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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