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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001490`

染色体: Chr05 坐标: 13667925-13674438 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001490`
名称	SmilChr05G001490
描述	mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13667925 - 13674438 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986182`
GeneID	`130986182`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986182`
原始查询	`SmilChr05G001490`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50-like
产物	mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50-like
Arabidopsis	`AT1G55900` (TIM50) Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842040] identity=63.4; qcov=0.988; evalue=2.87e-120; confidence=high
Rice	`Os01g0762400` - identity=71.5; qcov=0.919; evalue=9.94e-125; confidence=high
GO	GO:0004721 (phosphoprotein phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03031 (NIF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986182

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057765482.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057765482.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057765482.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057765484.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765484.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13668141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr5:13668142`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr5:13668142`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr5:13670784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B57,C24
`Chr5:13671175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:13671698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B64
`Chr5:13672913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C12,C14,C45,C47
`Chr5:13673079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:13673156`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A1,A2,A21,A23,A25,A6,B104,B117,B19,B21,B31,B36,B40,B41,B42,B43,B46,B48,B70,B71,B99,C12,C3,C34,C36,C51,C52,C62,C64,C66,C80,C83,D6
`Chr5:13673184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765482.1

363 aa

182

363

NIF

PF03031 NIF 173-318 aa

XP_057765483.1

358 aa

179

358

NIF

PF03031 NIF 173-318 aa

XP_057765484.1

260 aa

130

260

NIF

PF03031 NIF 75-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765482.1`	Pfam	`PF03031`	NIF	Family	173	318	7.6e-40	136.9	NLI interacting factor-like phosphatase
`XP_057765483.1`	Pfam	`PF03031`	NIF	Family	173	318	7.3e-40	137.0	NLI interacting factor-like phosphatase
`XP_057765484.1`	Pfam	`PF03031`	NIF	Family	75	220	3.5e-40	138.0	NLI interacting factor-like phosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089200.1
TTTTCGTCATTCTACTTAACAAACTTCAACAGGACTCGACAATCGTTTCAGAAAAACCCCGTGACACTACTCTGAGCATTCCAAAACCCTAATCAGAGCTGCAGAAAAATTGATAATGTCAGCTTTGCTGCGATCTTCGTCGCGTTTGTTCTCCACAATCTCTAGGAGAAATAGTGGACTTTCTTCAAATTTCGCTTCAGAATCGCCCAAGCCAACGATGATCTCTTCCGCGATCCTCGGTGATCAGCCTCCGCCATCAG...

XM_057909500.1
AACGGGCGGGGCATTTTCGTCATTCTACTTAACAAACTTCAACAGGACTCGACAATCGTTTCAGAAAAACCCCGTGACACTACTCTGAGCATTCCAAAACCCTAATCAGAGCTGCAGAAAAATTGATAATGTCAGCTTTGCTGCGATCTTCGTCGCGTTTGTTCTCCACAATCTCTAGGAGAAATAGTGGACTTTCTTCAAATTTCGCTTCAGAATCGCCCAAGCCAACGATGATCTCTTCCGCGATCCTCGGTGATCAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986182
ATGTCAGCTTTGCTGCGATCTTCGTCGCGTTTGTTCTCCACAATCTCTAGGAGAAATAGTGGACTTTCTTCAAATTTCGCTTCAGAATCGCCCAAGCCAACGATGATCTCTTCCGCGATCCTCGGTGATCAGCCTCCGCCATCAGAGGATCTGCCGCCTTTACGGGAACCAGAGGCTGTGAAAAGTTCCTGGAGCTTTCTTAAGTATGGAATCATCGCCGCGCTCACCGGCACTGCTGCTACTGCAGGCTACGCTACCTA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765482.1
MSALLRSSSRLFSTISRRNSGLSSNFASESPKPTMISSAILGDQPPPSEDLPPLREPEAVKSSWSFLKYGIIAALTGTAATAGYATYAYSLDEIDENSKALRASTNVTIGDDVNSSDKYKAYLRAAAMTGLSKLVEGYLDLRRLTEEHVKGFTEPISDKLLPDLHPLEKHIFTLVLDLNETLIYSEWKRDRGWRTFKRPGVDEFLEHLAQFYEIVVYSDQLITYVDPVAERLDPKNCIRYRLSRVATRYIDGKHYRDLSM...

XP_057765483.1
MSALLRSSSRLFSTISRRNSGLSSNFASESPKPTMISSAILGDQPPPSEDLPPLREPEAVKSSWSFLKYGIIAALTGTAATAGYATYAYSLDEIDENSKALRASTNVTIGDDVNSSDKYKAYLRAAAMTGLSKLVEGYLDLRRLTEEHVKGFTEPISDKLLPDLHPLEKHIFTLVLDLNETLIYSEWKRDRGWRTFKRPGVDEFLEHLAQFYEIVVYSDQLITYVDPVAERLDPKNCIRYRLSRVATRYIDGKHYRDLSM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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