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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001493`

染色体: Chr05 坐标: 13691629-13693460 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001493`
名称	SmilChr05G001493
描述	pectinesterase QRT1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13691629 - 13693460 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986185`
GeneID	`130986185`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986185`
原始查询	`SmilChr05G001493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase QRT1
产物	pectinesterase QRT1
Arabidopsis	`AT5G55590` (QRT1) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835653] identity=52.4; qcov=1.01; evalue=8.39e-121; confidence=high
Rice	`Os07g0607400` (OsPME20) - identity=48.5; qcov=0.842; evalue=6.3e-89; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986185

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057765487.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057765487.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765487.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765487.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765487.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13691871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:13692037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C85
`Chr5:13692067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C61
`Chr5:13692089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr5:13692368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B35,B63,C71,D1
`Chr5:13692380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:13693128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr5:13693170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765487.1

348 aa

174

348

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 49-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765487.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	49	343	2.5e-56	191.3	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909504.1
ATCATAAATCCTTGTTGTATTCGACTTAGGAGTTGTTTAAACTTTAAAACACCGCCATCTTTGTGTTTTGGATGCCATAAACCTTTCTTTTTGTCCCCTTAAATCTTGGTTTATACATCTCCATCGTCGTTATATATACATGCAATTATGTGCGGTGTTTCACGTTGAGGATTACGGCTCACCCACGCTCTCCTTATTTATTGCTCTCACTGCTTCAATCCTCACAAAATACGTCTTTTCTTTTGTGCGATGAATTTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986185
ATGAATTTGAGGGCCTGGATTTTCATTGTTTTTGTGGTGTGCGCCCAAGCTCAAACGGAGACACGAAGTTATATATCGTGGAACGATTTGAGATTGGATGGCGGTAGTGCTACTTTAGAGAATGGAGGTGATCCCACTAAACTCATCGTCGTTTCTCAAAACGGCACCGGAGATTCTCTCACCGTTCAAGGCGCTATTGATTTGGTGCCGGAGAATAATACCCACCGTGTCAAAATCTATGTTCATCCTGGAATTTACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765487.1
MNLRAWIFIVFVVCAQAQTETRSYISWNDLRLDGGSATLENGGDPTKLIVVSQNGTGDSLTVQGAIDLVPENNTHRVKIYVHPGIYREKVHIPANKPYITLIGDEDKANETVITWHDKAGDKTADGGFLGTWNSASVTVLSDYMCATSITFENTVIVKADLGVNGYQAVALRIAGKHAMFYRVRFLGSQDTLLDQDGSHYFLECFIQGTTDFIFGRATSLYKDCNISVVGDGFAIAAHHRDSPLDQTGFSFLNCTVRGTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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