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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001506`

染色体: Chr05 坐标: 13807319-13814489 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001506`
名称	SmilChr05G001506
描述	putative DUF21 domain-containing protein At3g13070, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13807319 - 13814489 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986200`
GeneID	`130986200`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986200`
原始查询	`SmilChr05G001506`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative DUF21 domain-containing protein At3g13070, chloroplastic
产物	putative DUF21 domain-containing protein At3g13070%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G55930` (AT1G55930) CBS domain-containing protein / transporter associated domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842044] identity=73; qcov=0.876; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0593200` (OsCBSDUFCH1) - identity=73.9; qcov=0.783; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00571 (CBS); PF01595 (CNNM); PF03471 (CorC_HlyC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986200

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765497.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057765497.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057765497.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765497.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13807689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13807703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:13807867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69
`Chr5:13807923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:13810776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B102,B33,B72,C48
`Chr5:13812902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765497.1

669 aa

334

669

CNNM

CBS

CorC_HlyC

PF01595 CNNM 166-343 aa PF00571 CBS 358-416 aa PF00571 CBS 426-481 aa PF03471 CorC_HlyC 504-606 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765497.1`	Pfam	`PF01595`	CNNM	Domain	166	343	1.5e-48	165.6	Cyclin M transmembrane N-terminal domain
`XP_057765497.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	358	416	4.9e-15	56.3	CBS domain
`XP_057765497.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	426	481	4.9e-15	56.3	CBS domain
`XP_057765497.1`	Pfam	`PF03471`	CorC_HlyC	Domain	504	606	1.7e-15	57.5	Transporter associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909514.1
CATTAAGTGCTGCAAGTTGGCTGAAACCTTCCCTTCGATTCCAGCGTACAGAGAAAAGAAATCCGCAGAGCTACACCAGTCGTAGCTCTGGGACAACAATAAACCACGATGAGCTTCGCAGCTGCTGCATTCAGACTCCCGCAACCGCAACAACCCCTTCATTCATCTCTCTCTCACTAACCACCAACTCTTTTTAATCTGTTTGTGCTGTATTCATTATGATCATACACAACTACTTCATGGCTGCGTCTGAAACCACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986200
ATGATCATACACAACTACTTCATGGCTGCGTCTGAAACCACATTGTTTAATCGATCCGCTCTCATCACCGCTTCAAATCCTTCCTTCATCTTCCGTCGCCGTTCCTTGTTGAGATTATCCCCTAAATTGGCCGCAAAGAAGCTTGCCTGCTGCTCCTGTTGTCCACCGCCCTACAACTCCCCAATCCTTTTGTTCAATTGTAATAAAAGAAGTCCTCTTTCTTTGCTTTCTGTTAAAACTAGTTGTCGTGTGAATGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765497.1
MIIHNYFMAASETTLFNRSALITASNPSFIFRRRSLLRLSPKLAAKKLACCSCCPPPYNSPILLFNCNKRSPLSLLSVKTSCRVNDDINSPAARAIDFGEVLARRGLAIAAAVAIGAVVILTCRRALAAEGVVAAGYGVWERNLSAMRSSWPKVLQVLTVFKEQGLILAALLGLSAFFSMAETSITTLWPWKVRELAEKESENGVFKMLRNDVTRFLTTILIGTTVVNIGATALVTEAATAIFGEAGVSAATGVMTVAIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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