当前解析结果
SmilChr05G001509| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001509 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001509 |
| 描述 | heavy metal-associated isoprenylated plant protein 47 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 13851459 - 13852180 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986202 |
|---|---|
| GeneID | 130986202 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986202 |
| 原始查询 | SmilChr05G001509 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | heavy metal-associated isoprenylated plant protein 47 |
| 产物 | heavy metal-associated isoprenylated plant protein 47 |
| Arabidopsis | AT4G05030 (AT4G05030)Copper transport protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825845] identity=50; qcov=1; evalue=2.72e-19; confidence=low |
| Rice | Os04g0469000- identity=57.4; qcov=0.895; evalue=1.03e-20; confidence=low |
| GO | GO:0046872 (metal ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986202 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057765502.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057765502.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057765502.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765502.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765502.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:13851784 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B108,B131 |
Chr5:13851923 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C11,C69,C74,D10 |
Chr5:13851935 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr5:13851945 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B115,B138,B20,C1 |
Chr5:13852025 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。