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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001519`

染色体: Chr05 坐标: 13913791-13917354 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001519`
名称	SmilChr05G001519
描述	truncated FRIGIDA-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13913791 - 13917354 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986211`
GeneID	`130986211`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986211`
原始查询	`SmilChr05G001519`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	truncated FRIGIDA-like protein 1
产物	truncated FRIGIDA-like protein 1
Arabidopsis	`AT5G16320` (FRL1) FRIGIDA like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831493] identity=30.8; qcov=1.04; evalue=1.87e-66; confidence=low
Rice	`Os09g0248300` - identity=32.9; qcov=0.786; evalue=2.98e-49; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07899 (Frigida)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986211

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765517.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765517.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765517.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765517.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765517.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13914194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:13916459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D4
`Chr5:13916787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:13916946`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr5:13916946`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6
`Chr5:13916949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765517.1

514 aa

257

514

Frigida

PF07899 Frigida 87-368 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765517.1`	Pfam	`PF07899`	Frigida	Family	87	368	1.9e-85	287.4	Frigida-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909534.1
CTCCTCATAAAATACATTTATTTTATTTTTGTTAAAGCAACACGTCTCGTGTAGCATCGTCGTTCTTCTTCATTGTGTTCCACTGTTGGTCTCTCTGGATTCCGTTACCAATAAATGTTATTCAGAAATTTGCGTGCCCACTGATTACCAAATCCCGCGCTCAGCACAGTCCGCAATTCTGAACGCTATGGCGTTGACGACTGTAAAATCGATCGAACAGGCGCTCAGCCTCGTCGACGAGAAGAAGCAGAGTTTGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986211
ATGGCGTTGACGACTGTAAAATCGATCGAACAGGCGCTCAGCCTCGTCGACGAGAAGAAGCAGAGTTTGAAAAAAGCCTTCGAAGAATTGGAATCGCGTTCCTCTTCGCTCTCCTCCTTGAATTTCGCATGGACTGATCTCGACTCGTATTTCTCCGGCGCCCAATCCGAGCTCCTCGACAAATTGGCCGTCCTTCAAGCCCTAGAATCCTCTAAAACCGGTAACGAAAAAAACTCGCTATTGTCAGAGCCGGTGCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765517.1
MALTTVKSIEQALSLVDEKKQSLKKAFEELESRSSSLSSLNFAWTDLDSYFSGAQSELLDKLAVLQALESSKTGNEKNSLLSEPVLARPELKSFCEKMDALGLRKYVLDRPKERAAIRAELADAFKHAPDAGSMVLDTLEGFWDDKLGSGSRLRTACVVLLEELMRAGVEMRAEVRERATAVASEWKVKMAELNCEGDEEGKEEDWGLERLGYLQLLASYNLLIDGEFDVNELVDYVVMSARYRQTVDLCRVLRLEGRIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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