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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001524`

染色体: Chr05 坐标: 13958276-13962817 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001524`
名称	SmilChr05G001524
描述	protein TORNADO 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13958276 - 13962817 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986216`
GeneID	`130986216`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986216`
原始查询	`SmilChr05G001524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TORNADO 1
产物	protein TORNADO 1
Arabidopsis	`AT5G55540` (TRN1) tornado 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835648] identity=63.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0237502` - identity=22.7; qcov=0.345; evalue=4.72e-12; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13516 (LRR_6); PF25497 (COR-B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986216

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057765527.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057765527.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057765527.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057765527.1`
5	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.40000	`XP_057765527.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13958482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B38,B39,B79,B86
`Chr5:13958551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:13958694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B38,B39,B79,B86
`Chr5:13958758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:13958836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:13958889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B29,B67,C20,C51
`Chr5:13958923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,D9
`Chr5:13958941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,D3
`Chr5:13958989`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B21
`Chr5:13958989`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B21
`Chr5:13959170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:13959349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765527.1

1369 aa

684

1369

LRR_6

COR-B

PF13516 LRR_6 277-300 aa PF25497 COR-B 892-1017 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765527.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	277	300	3.5e-10	39.9	Leucine Rich repeat
`XP_057765527.1`	Pfam	`PF25497`	COR-B	Domain	892	1017	3.4e-12	47.0	C-terminal of Roc, COR-B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909544.1
ATTACAATTTTACTTTTCCGCGTTGTCAGGATTCTTTGATTGTTGGAGTGGGAACAGAGAAGAGAAGAATTGAAGAAAGTGTGCTCCCAGATAAAAGTTGCGGGGAGGAAAGAAAAAGTGAAGTAGTGAAAATCCAAGCAAAGAATGATTTAAGTAAAGAATCCTAAGAAGAAGAAATAGTGGATAGAAATGGGAAGCGTTAAAGACGTAGAATGGGCGGCGCAAGGGCTGGAATCCGGCGGCCTCGACCTCCACACCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986216
ATGGGAAGCGTTAAAGACGTAGAATGGGCGGCGCAAGGGCTGGAATCCGGCGGCCTCGACCTCCACACCGTCTGTTTTGTCCTTGGCGACCCACCTTCCTCAGTTTGTTTCCTGGAAACACAAAACTCCATCAACCTCAACATATCCAGAGACGCCCTCCCACGCTTCCTCAAACTCCTCGCAACATCAAGATTGAGAAACATAGAGTTCCAGCTGGTACAATGGGAGCCGCAGCACATGAAGCATCTCCGAACGCTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765527.1
MGSVKDVEWAAQGLESGGLDLHTVCFVLGDPPSSVCFLETQNSINLNISRDALPRFLKLLATSRLRNIEFQLVQWEPQHMKHLRTLLQANPNIRHLLFKRNSFTAHCLSELSEALRHNQSVKEIVLSESGIGPQGAGLLASALRDNRSLEELQIWEDSIGSKGADELSKMIELNSSLKLLTIFDSNPITATPLISAVLGRNRSMEVHIWSVDRRERSCKMVEFAPENSTLRVYRADVSAACRVACALGWNTTVRSLDMSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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