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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001530`

染色体: Chr05 坐标: 14015431-14017879 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001530`
名称	SmilChr05G001530
描述	chloroplastic import inner membrane translocase subunit TIM22-2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14015431 - 14017879 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986221`
GeneID	`130986221`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986221`
原始查询	`SmilChr05G001530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloroplastic import inner membrane translocase subunit TIM22-2-like
产物	chloroplastic import inner membrane translocase subunit TIM22-2-like
Arabidopsis	`AT4G26670` (AT4G26670) Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828774] identity=66.5; qcov=0.985; evalue=2.56e-82; confidence=high
Rice	`Os12g0514900` - identity=63.8; qcov=0.812; evalue=6.78e-68; confidence=high
GO	GO:0008320 (transmembrane protein transporter activity); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0042721 (TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex); GO:0045036 (protein targeting to chloroplast); GO:0045039 (protein insertion into mitochondrial inner membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02466 (Tim17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986221

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057765540.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057765540.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057765540.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057765540.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765540.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14015719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,A2
`Chr5:14015737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:14016968`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B130
`Chr5:14016968`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B130
`Chr5:14017607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr5:14017654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B104,B118,B27,B70
`Chr5:14017696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B27,B70
`Chr5:14017697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765540.1

197 aa

197

Tim17

PF02466 Tim17 46-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765540.1`	Pfam	`PF02466`	Tim17	Family	46	144	1.2e-14	55.2	Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909557.1
AGTTATATTGTGACAATTAATCAGCTTATTTAAGTTTCTATTTCTGTTTCTATTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTACTGACATTGTCGTTTTTCGAATATCCAATTATCTGAAGAAGCGAACATTTATGAATATTTCCTGTGAAAGCGCAAAGTACAATCAGCGAAGCGTCGTCGATTTTTCTAGGGTTCCTCTTCATTCAAGCATACAATGTCGACGCCGAAAAACACTAAGAATTCCGACTCGGAATCGGAGATTGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986221
ATGTCGACGCCGAAAAACACTAAGAATTCCGACTCGGAATCGGAGATTGAGAACGTTCCAAGCCACGAATCGAGTTTCGCGTCCGACTCTCTGGCTACCGCTAATCCGTCGAGTCCTCCTATTGTTTGCCTCTTTAAATTCGCCGGTGACTCCGCCGGCGGTGCTTTAATGGGCTCCATTTTTGGCTACGGGTCCGGATTAATTAAGAAGAAGGGCTTTAAGGGATCATTTCCAGAAGCTGGATCTTCTGCCAAGACATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765540.1
MSTPKNTKNSDSESEIENVPSHESSFASDSLATANPSSPPIVCLFKFAGDSAGGALMGSIFGYGSGLIKKKGFKGSFPEAGSSAKTFAVLSGVHSLVVCFLKRLRGKDDVINAGVAGCCTGLALSFPGAPQALLQSCLTFGAFSFIIEGLNKQQPALAQPFSTRVNRQHNGVLPPLALPLPNELKESFASFCRSIRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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