当前解析结果
SmilChr05G001532| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001532 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001532 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G001532 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 14030526 - 14031701 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986225 |
|---|---|
| GeneID | 130986225 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986225 |
| 原始查询 | SmilChr05G001532 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0147500; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os11g0147500; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G06130 (AT3G06130)Heavy metal transport/detoxification superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819786] identity=37.8; qcov=0.356; evalue=4.71e-08; confidence=low |
| Rice | Os11g0147500- identity=34.2; qcov=0.365; evalue=4.21e-08; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986225 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057765550.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057765550.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765550.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765550.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057765550.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:14030673 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B80 |
Chr5:14030673 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr5:14031206 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B33,B68,C48 |
Chr5:14031207 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,B53 |
Chr5:14031255 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B22,B91 |
Chr5:14031336 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B37 |
Chr5:14031431 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。