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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001534`

染色体: Chr05 坐标: 14033583-14035647 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001534`
名称	SmilChr05G001534
描述	40S ribosomal protein S8
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14033583 - 14035647 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986224`
GeneID	`130986224`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986224`
原始查询	`SmilChr05G001534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S8
产物	40S ribosomal protein S8
Arabidopsis	`AT5G59240` (AT5G59240) Ribosomal protein S8e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836042] identity=84.4; qcov=0.94; evalue=1.05e-124; confidence=high
Rice	`Os04g0349500` - identity=86.5; qcov=1.02; evalue=1.65e-137; confidence=high
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01201 (Ribosomal_S8e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986224

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765549.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765549.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765549.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765549.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14034520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B38,B39,B79
`Chr5:14034932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B14,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765549.1

218 aa

109

218

Ribosomal_S8e

PF01201 Ribosomal_S8e 5-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765549.1`	Pfam	`PF01201`	Ribosomal_S8e	Family	5	196	2.7e-53	180.5	Ribosomal protein S8e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909566.1
CCCTTCACCCAAACGACGTCGTCAAGGGAGGGATATATTTATAATTTACTCCAGTTAGGGTTTTTGCTTCGAGTATAAATCCCCAGCCACCCGCTATACTTATTCTTCTATTTGCTGGCCGCCTCTTCCGTCATTGCTTAACGTCGGAACCCTAGAATCCCCAATCGTCAATCATGGGTATCTCACGGGATTCAATGCACAAGAGACGTGCAACTGGAGGAAAGAAGAAGGCATGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986224
ATGGGTATCTCACGGGATTCAATGCACAAGAGACGTGCAACTGGAGGAAAGAAGAAGGCATGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTCGGAAGACAACCGGCTAACACAAAGTTGTCGAGCAACAAGACAGTGCGCAGGGTGAGAGTTCGAGGAGGTAATGTGAAGTGGCGTGCCTTGAGGTTGGATACAGGAAACTATTCTTGGGGTAGTGAAGCTGTAACCAGAAAGACCCGTATTTTGGATGTGGTTTACAATGCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765549.1
MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSNKTVRRVRVRGGNVKWRALRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKGAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVEIGRKKKAAAKKEGEETTEAATEEVKKSNHVQRKLEKRQQDRKIDTHIEEQFGGGRLLAAISSRPGQCGRCDGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGASA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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