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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001541`

染色体: Chr05 坐标: 14119806-14124876 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001541`
名称	SmilChr05G001541
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 6
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14119806 - 14124876 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986234`
GeneID	`130986234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986234`
原始查询	`SmilChr05G001541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 6
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 6
Arabidopsis	`AT1G04950` (TAFII59) TATA BOX ASSOCIATED FACTOR II 59 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839370] identity=59.3; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0510800` (TAF6) - identity=65; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000124 (SAGA complex); GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0005669 (transcription factor TFIID complex); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter); GO:0016251 (RNA polymerase II general transcription initiation factor activity); GO:0046695 (SLIK (SAGA-like) complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity); GO:0051123 (RNA polymerase II preinitiation complex assembly)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02969 (TAF); PF07571 (TAF6_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765557.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057765557.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765557.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765557.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14120321`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A14,A8,B1,B10,B100,B107,B11,B12,B132,B140,B24,B38,B39,B45,B49,B53,B55,B63,B65,C10,C17,C19,C25,C26,C42,C69,C70,C80,C84,D6,D8,D9
`Chr5:14120523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:14120819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:14121306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr5:14121364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,D9
`Chr5:14121677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B31,B57,B90,B92
`Chr5:14124511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:14124619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:14124622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765557.1

540 aa

270

540

TAF

TAF6_C

PF02969 TAF 1-65 aa PF07571 TAF6_C 171-352 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765557.1`	Pfam	`PF02969`	TAF	Domain	1	65	6.9e-31	106.9	TATA box binding protein associated factor (TAF)
`XP_057765557.1`	Pfam	`PF07571`	TAF6_C	Repeat	171	352	1.2e-74	250.7	TAF6 C-terminal HEAT repeat domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909574.1
CCGTAATTTAACTGAACTGGAGTACAAATAAATAAAACCAAAAATATAATGTCTCCCAACTCTCGCCATTCTCTTCTCTTTCTTCACATTCCCTTCAAAACACAGGAAATTCAAATCTGAATTTCGCTCTTCTCCTCTCTTAAATCCGGCGAGGGCTCGCCGTTCAACACCGCCGGCAAACCTTCTCTTATATTTCTTGGCCGAGTGGCACTTCTTCTCAACCCTCGAAAAGCAGCAACCACACAAACCCCTCTACTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986234
ATGAGCATCGTACCGAAAGAAACAATTGAGGTTATAGCCCAGAGCATTGGCATCAGCAATTTATCACCTGATGTGTTGCCTGCTCTGGCTGCTGATGTAGAGTACCGCGTTCGAGAAATCATGCAGGAAGCTATCAAATGCATGCGGCATTCGAAGAGAACTACTTTAACTACGGATGACGTTGATAGTGCGCTCGGTTTAAGAAATGTCGAGCCAATATATGGATTTGCGTCTGGAGATCCGTTGCGATTCAAAAGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765557.1
MSIVPKETIEVIAQSIGISNLSPDVLPALAADVEYRVREIMQEAIKCMRHSKRTTLTTDDVDSALGLRNVEPIYGFASGDPLRFKRAAGHKDLFYIEEKDVEFKEVIEAPLPKAPLDTAVVAHWLAIEGVQPAIPENPPPEALQMLSLPADNRKTEVKEDGVPVDIKLPIKHVLSRELQLYFEKITELTVSRSESPLFKAALVSLATDSGIHPLVPYFTFFVADEVSRNLSNFSLLFALMRLVWSLLRNPHIHIEPYLHQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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