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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001543`

染色体: Chr05 坐标: 14130024-14133923 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001543`
名称	SmilChr05G001543
描述	sodium/hydrogen exchanger 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14130024 - 14133923 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986236`
GeneID	`130986236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986236`
原始查询	`SmilChr05G001543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sodium/hydrogen exchanger 4
产物	sodium/hydrogen exchanger 4
Arabidopsis	`AT5G55470` (NHX3) Na+/H+ (sodium hydrogen) exchanger 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835640] identity=73.9; qcov=0.581; evalue=2.74e-156; confidence=medium
Rice	`Os06g0318500` (OsNHX4) - identity=71.5; qcov=0.575; evalue=9.22e-139; confidence=medium
GO	GO:0006814 (sodium ion transport); GO:0006885 (regulation of pH); GO:0015385 (sodium:proton antiporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00999 (Na_H_Exchanger)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057765560.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057765560.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765560.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765560.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765560.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14130105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B124,B55,B78,C66
`Chr5:14130408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C10,C3
`Chr5:14130754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr5:14130910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C64
`Chr5:14131049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B66,C26,C43,D10
`Chr5:14131056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B50,B57
`Chr5:14131062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr5:14131080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:14131089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:14131210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B27,B50,B57
`Chr5:14131214`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B23,B75
`Chr5:14131214`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B23,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765560.1

601 aa

300

601

Na_H_Exchanger

PF00999 Na_H_Exchanger 107-518 aa

XP_057765562.1

494 aa

247

494

Na_H_Exchanger

PF00999 Na_H_Exchanger 107-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765560.1`	Pfam	`PF00999`	Na_H_Exchanger	Domain	107	518	1.2e-55	189.6	Sodium/hydrogen exchanger, transmembrane
`XP_057765562.1`	Pfam	`PF00999`	Na_H_Exchanger	Domain	107	367	7.4e-37	127.8	Sodium/hydrogen exchanger, transmembrane

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909579.1
TCTATCCAATTTTGAAATAAAATAAAAATATAATCGAAGAAATGAAATATGGTTGGGTCGAGTAATCGGTTTTGTACAGGGCGTATGGAGGAGAGAGAAAGAGAAGCATGGGTTGGAGCAGGAGCAGGATCATTAACAGCCTCGGACACGTACCAGTATGCGCCCTCGAATTCGCGCCACCTGGCTCTTACCTCTACACATCACTCCCATCTCTCTTCTTCTTCTTCACCATCATCCTCGCCTAATTCTCACTTCTCCAA...

XM_057909577.1
CCAATTTTGAAATAAAATAAAAATATAATCGAAGAAATGAAATATGGTTGGGTCGAGTAATCGGTTTTGTACAGGGCGTATGGAGGAGAGAGAAAGAGAAGCATGGGTTGGAGCAGGAGCAGGATCATTAACAGCCTCGGACACGTACCAGTATGCGCCCTCGAATTCGCGCCACCTGGCTCTTACCTCTACACATCACTCCCATCTCTCTTCTTCTTCTTCACCATCATCCTCGCCTAATTCTCACTTCTCCAACCTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986236
ATGGTTGGGTCGAGTAATCGGTTTTGTACAGGGCGTATGGAGGAGAGAGAAAGAGAAGCATGGGTTGGAGCAGGAGCAGGATCATTAACAGCCTCGGACACGTACCAGTATGCGCCCTCGAATTCGCGCCACCTGGCTCTTACCTCTACACATCACTCCCATCTCTCTTCTTCTTCTTCACCATCATCCTCGCCTAATTCTCACTTCTCCAACCTTCTCATCCATCAATCAATGGAACTGGATAGCTTATGGAATATCGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765560.1
MVGSSNRFCTGRMEEREREAWVGAGAGSLTASDTYQYAPSNSRHLALTSTHHSHLSSSSSPSSSPNSHFSNLLIHQSMELDSLWNIAANFGETHQQVVPITVFVAVLCFCLIVGHLLEENRWVNESITALIIGCATGTIILLISKGKSSHILRFDEEIFFIYLLPPIIFNAGFQVKKKQFFHNFFPIMLFGVVGVFISSSIVTVGSWLMFPMFGFVGLTPRDFLGIGTIFSSTDTVCTLQVLHQDETPLLYSLVFGEGVV...

XP_057765562.1
MVGSSNRFCTGRMEEREREAWVGAGAGSLTASDTYQYAPSNSRHLALTSTHHSHLSSSSSPSSSPNSHFSNLLIHQSMELDSLWNIAANFGETHQQVVPITVFVAVLCFCLIVGHLLEENRWVNESITALIIGCATGTIILLISKGKSSHILRFDEEIFFIYLLPPIIFNAGFQVKKKQFFHNFFPIMLFGVVGVFISSSIVTVGSWLMFPMFGFVGLTPRDFLGIGTIFSSTDTVCTLQVLHQDETPLLYSLVFGEGVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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