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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001544`

染色体: Chr05 坐标: 14136522-14138957 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001544`
名称	SmilChr05G001544
描述	rho GDP-dissociation inhibitor 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14136522 - 14138957 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986237`
GeneID	`130986237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986237`
原始查询	`SmilChr05G001544`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rho GDP-dissociation inhibitor 1-like
产物	rho GDP-dissociation inhibitor 1-like
Arabidopsis	`AT3G07880` (SCN1) Immunoglobulin E-set superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819979] identity=69.2; qcov=0.908; evalue=2.66e-99; confidence=high
Rice	`Os02g0719000` - identity=71.6; qcov=0.807; evalue=9.58e-94; confidence=high
GO	GO:0005094 (Rho GDP-dissociation inhibitor activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0007266 (Rho protein signal transduction); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02115 (Rho_GDI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765563.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765563.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765563.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765563.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765563.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14137478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B33,C48
`Chr5:14137669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr5:14137881`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A11,B117,B33,B70,B83,B94,C67,C84
`Chr5:14137894`	`T`	`TA`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	10	A11,B117,B33,B68,B70,B83,B94,C48,C67,C84
`Chr5:14137902`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	10	A11,B117,B33,B68,B70,B83,B94,C48,C67,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765563.1

220 aa

110

220

Rho_GDI

PF02115 Rho_GDI 32-217 aa

XP_057765564.1

220 aa

110

220

Rho_GDI

PF02115 Rho_GDI 32-217 aa

XP_057765565.1

218 aa

109

218

Rho_GDI

PF02115 Rho_GDI 32-215 aa

XP_057765566.1

218 aa

109

218

Rho_GDI

PF02115 Rho_GDI 32-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765563.1`	Pfam	`PF02115`	Rho_GDI	Domain	32	217	1.3e-80	270.3	RHO protein GDP dissociation inhibitor
`XP_057765564.1`	Pfam	`PF02115`	Rho_GDI	Domain	32	217	1.3e-80	270.3	RHO protein GDP dissociation inhibitor
`XP_057765565.1`	Pfam	`PF02115`	Rho_GDI	Domain	32	215	6.7e-82	274.5	RHO protein GDP dissociation inhibitor
`XP_057765566.1`	Pfam	`PF02115`	Rho_GDI	Domain	32	215	6.7e-82	274.5	RHO protein GDP dissociation inhibitor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909582.1
AGAAAAAAAAGCGAGCAGAAGGCCGCATCTTCCGCTGAGTAATATATATGAAGAAATAAATAGATTAAATATTCCACATATACATGAATAGTTTAGGCCATAATTACCCAGTATTTAGCATGTATAATCTCGGATCACCACAAATAAAGTGGCATTCCCCTTTTGAATGATCATCTCCCTTTTATCCTTCCCTTGAATGAAGCCACCATCATTTTTCACCACCTAAACAAGACAAGTTTTCTTTCCCTTTGCACAATTCA...

XM_057909581.1
ATAATTACCCAGTATTTAGCATGTATAATCTCGGATCACCACAAATAAAGTGGCATTCCCCTTTTGAATGATCATCTCCCTTTTATCCTTCCCTTGAATGAAGCCACCATCATTTTTCACCACCTAAACAAGACAAGTTTTCTTTCCCTTTGCACAATTCACATACTTAATTGGTGCACTATTTTTCCTTCCTTCTTTCGTTTGGTTCTTGGAGAAGGCGTTGATGATTAGAAAGTCAGCAATCTGTTAGTTAAGAGAGT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130986237
ATGGATTCAGAGAGTAGTTCGTCGTTGAAAGAGGAGTTGTCTGACTCAGAGGGGAAACCGATTAGTCGGCAGCCGAGTGAAGCTTCCATTTACACCGAGGACGACGAAGAACTCGGACACATCCAGCTCGGCCCTAAATGTACGATTAAGGAACATCTCGAGAAAGACAAGGATGATGAGAGCTTGAGGAAGTGGAAGGAACAACTCCTAGGAGGTGTGGATGTGAACGCCATTGAAGATGCAGAGTCTCAAGAGCCAGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057765563.1
MDSESSSSLKEELSDSEGKPISRQPSEASIYTEDDEELGHIQLGPKCTIKEHLEKDKDDESLRKWKEQLLGGVDVNAIEDAESQEPDVKIMSLTISSEGRPDIVLPIPESGNVKGLWFTLKEGSHYRLRFSIKVSNDIVCGLKYTNTVWKSGIKVDSSKQMLGTFSPQAEPYLHEMDEETTPAGVFARGTYSARTKFIDDDKKCYLEINYTFDIQKEWGK

XP_057765564.1
MDSESSSSLKEELSDSEGKPISRQPSEASIYTEDDEELGHIQLGPKCTIKEHLEKDKDDESLRKWKEQLLGGVDVNAIEDAESQEPDVKIMSLTISSEGRPDIVLPIPESGNVKGLWFTLKEGSHYRLRFSIKVSNDIVCGLKYTNTVWKSGIKVDSSKQMLGTFSPQAEPYLHEMDEETTPAGVFARGTYSARTKFIDDDKKCYLEINYTFDIQKEWGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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