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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001551`

染色体: Chr05 坐标: 14241996-14244233 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001551`
名称	SmilChr05G001551
描述	early nodule-specific protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14241996 - 14244233 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986241`
GeneID	`130986241`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986241`
原始查询	`SmilChr05G001551`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	early nodule-specific protein 2-like
产物	early nodule-specific protein 2-like
Arabidopsis	`AT4G26750` (EXT-like) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828782] identity=50.6; qcov=0.258; evalue=1.51e-25; confidence=weak
Rice	`Os06g0308800` - identity=44.7; qcov=0.289; evalue=1.06e-26; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF18097 (Vta1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986241

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765573.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057765573.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057765573.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765573.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765573.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14242160`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A14,A15,A2,A4,A8,A9,B108,B128,B17,B20,B21,B22,B23,B25,B3,B32,B33,B35,B43,B48,B5,B52,B58,B61,B64,B7,B70,B78,B8,B83,B91,B93,B99,C10,C14,C15,C21,C29,C31,C34,C37,C48,C49,C56,C62,C63,C65,C74,C76,C83,C84,D1,D10,D4,D7
`Chr5:14242197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B64,C34,C64
`Chr5:14242248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:14242277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C29
`Chr5:14242339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:14242401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr5:14242411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:14242473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C36,C43
`Chr5:14242739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B4,B74,B81,C4
`Chr5:14243049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:14243060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,C34,C4,C8
`Chr5:14243083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765573.1

682 aa

341

682

Vta1_C

PF18097 Vta1_C 639-676 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765573.1`	Pfam	`PF18097`	Vta1_C	Domain	639	676	3.3e-06	27.3	Vta1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909590.1
CAATTACTCAATTACTCTGGAGTAGATCCTACTTCAAGAATGGCACCAGATTCAGATTCGTTTCCTCAAGCCTATAATCGTGATAATTTTCAGCATCCTGCTAGTTTCTCACGACTACCTTCAAATGTTATGGGATCACCTGCTTCGGGTATTCCACCCCAATCTCATCATCCTACTGACAATTACTCTGGAGTCGATCCTGCTTCAAGAATGGCACCAGATTCAGATTCGTTTCCTCAAGCCTATAATCATGATAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986241
ATGGCACCAGATTCAGATTCGTTTCCTCAAGCCTATAATCGTGATAATTTTCAGCATCCTGCTAGTTTCTCACGACTACCTTCAAATGTTATGGGATCACCTGCTTCGGGTATTCCACCCCAATCTCATCATCCTACTGACAATTACTCTGGAGTCGATCCTGCTTCAAGAATGGCACCAGATTCAGATTCGTTTCCTCAAGCCTATAATCATGATAATTTTCAGCATCCTGCTAGTTTCTCACGACTACCTTCAAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765573.1
MAPDSDSFPQAYNRDNFQHPASFSRLPSNVMGSPASGIPPQSHHPTDNYSGVDPASRMAPDSDSFPQAYNHDNFQHPASFSRLPSNITGSPASGIPPQSHHPTDNYSGVDPTDNYSGVDPASRMAPDSDSFPQAYNHDNFQHPASFSRLPPNVMGSRASGIPPQSHHPTDNYSGVDPASRMAPDLDSFPQAYNHDNFQHPASFSRLPSNVMGSPASGIPPQSHHPTDNYSGVDLASRMAPDSDSFPQAYNHDNFQHFASF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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