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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001563`

染色体: Chr05 坐标: 14304820-14307953 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001563`
名称	SmilChr05G001563
描述	eIF-2-alpha kinase GCN2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14304820 - 14307953 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986250`
GeneID	`130986250`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986250`
原始查询	`SmilChr05G001563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eIF-2-alpha kinase GCN2-like
产物	eIF-2-alpha kinase GCN2-like
Arabidopsis	`AT3G59410` (GCN2) protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825110] identity=89.7; qcov=0.552; evalue=3.86e-30; confidence=medium
Rice	`Os06g0225900` - identity=78; qcov=0.39; evalue=3.49e-17; confidence=low
GO	GO:0004694 (eukaryotic translation initiation factor 2alpha kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986250

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765588.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765588.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765588.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765588.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765588.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14306034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:14306041`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B15,B87,C55
`Chr5:14306041`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B15,B87,C55
`Chr5:14306491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B24,B53,D6
`Chr5:14306493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr5:14306497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr5:14306522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:14306523`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr5:14306523`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr5:14306529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:14306558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:14306569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765588.1

105 aa

105

Pkinase

PF00069 Pkinase 6-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765588.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	6	64	4.2e-11	43.5	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909605.1
TTCCCCCAAATCCTTTCTTTCTCTCTCTCGTCTAATTCCCCCAAAACGTCACTCTCTCTCTCGTCCTCCCCCTAACCAGCGGCGCCACCCAAAACCACCAAACCCTAACTCTCTCTCTCGGCCTTCCCCAAGTCCGCCATGCCTCTGCGGGTCAGCCAAGGATGATGGCACCGTCGAACTCGCGTGCAACGCGGATGAGGCGGTTCCATCAAGGGAACGCCGAAGGCTAGGGCACATCGATGCGAAGCAAGGAAAAGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986250
ATGCCCGCCTCAAACGGACACGGTGGATTTGGCCACGTTGTATTATGCAAGAATAAGCTAGATGGTAGGCATTATGCCGTGAAGAAGATTCGATTGAAGGATAAAATTCTGCCTGTAAATGACCGCATATTAAGGGAAGTAGCTACTCTTTCGAGGTTGCAGCATCAGCATGTCGTTCGATACTATCAGGTTGACAGCATACTTAGCGCCTGTGGCGATGCTTTTGAGCATGAGGTAACTAGAAGAATGCGTAATGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765588.1
MPASNGHGGFGHVVLCKNKLDGRHYAVKKIRLKDKILPVNDRILREVATLSRLQHQHVVRYYQVDSILSACGDAFEHEVTRRMRNEFMVAWDGLRSKDNQRIIAG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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