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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001564`

染色体: Chr05 坐标: 14313990-14314802 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001564`
名称	SmilChr05G001564
描述	uncharacterized SmilChr05G001564
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14313990 - 14314802 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025548`
GeneID	`131025548`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025548`
原始查询	`SmilChr05G001564`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36; qcov=0.781; evalue=2.27e-45; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025548

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811325.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811325.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811325.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811325.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14314185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B138,C39
`Chr5:14314185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C39
`Chr5:14314226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C2
`Chr5:14314240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B93,C30
`Chr5:14314352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B41,B50,C4,C47
`Chr5:14314357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B75
`Chr5:14314369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:14314372`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,D10
`Chr5:14314372`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B41,D10
`Chr5:14314430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B123,B44
`Chr5:14314438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:14314449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B63,B73,B80,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811325.1

270 aa

135

270

DUF7769

PF24964 DUF7769 8-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811325.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	8	62	1.3e-11	44.6	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955342.1
ATGGCTATAGAAAGGCCAAAGTTACAAGATGATCAAAGAAACAAAGTTGCCCAGTGGCTGTTAGAGCATAGCAGTGAAGGCAAACTTCGCCATGGAGCAAAAAAAGAGGCGGCACTTCACTTCAAAGTAAACTTGAAGACCATTTGGAGGATTTGGAGCCAAGTCTCCAATCAAAGAGCATCCGGTGTACCTGTCCAGGTTAAATCAATTAGAAAAGGATGTATACACAAGGATAAGATGCTCATTGATGGTGAAAAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025548
ATGGCTATAGAAAGGCCAAAGTTACAAGATGATCAAAGAAACAAAGTTGCCCAGTGGCTGTTAGAGCATAGCAGTGAAGGCAAACTTCGCCATGGAGCAAAAAAAGAGGCGGCACTTCACTTCAAAGTAAACTTGAAGACCATTTGGAGGATTTGGAGCCAAGTCTCCAATCAAAGAGCATCCGGTGTACCTGTCCAGGTTAAATCAATTAGAAAAGGATGTATACACAAGGATAAGATGCTCATTGATGGTGAAAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811325.1
MAIERPKLQDDQRNKVAQWLLEHSSEGKLRHGAKKEAALHFKVNLKTIWRIWSQVSNQRASGVPVQVKSIRKGCIHKDKMLIDGEKVKKLSVLERSTLRCMSTHLGVSKSLLHQWVKEKKLKPHTNAIKPFLTTQNKLCRLRWSLKQLSGVSEDGFIPFQSMYNTIHIDEKWFYLTKTNDRYYLLPDEEEPHRTCKSKRHIEKIMFMCAAARPIIDEDGTVIFDGKLGIYPFITTEPAQRNSKNRVKGTLEVKAIAAITK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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